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| JC JC | NC_000913 | 3,731,420 | IS1 (–) +9 bp | coding (290‑298/993 nt) | xylF → | xylose ABC transporter periplasmic binding protein |
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ACCAACGTTGCTGCACACGCCAAAGAAGTCAAAATAGGTATGGCGATTGATGATCTCCGTCTTGAACGCTGGCAAAAAGATCGAGATATCTTTGTGAAAAAGGCAGAATCTCTCGGCGCGAAAGTATTTGTACAGTCTGCAAATGGCAATGAAGAAACACAAATGTCGCAGATTGAAAACATGATAAACCGGGGTGTCGATGTTCTTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAAAGAAGCCAAACAAGAAGGCATTAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCGCGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTTACGTTGATTCC > NC_000913/3731179‑3731664 | aCCAACGTTGCTGCACACGCCAAAGAAGTCAAAATAGGTATGGCGATTGATGATCTCCGTCTTGAACGCTGGCAAAAAGATCGAGATATCTTTGTGAAAAAGGCAGAATCTCTCGGCGCGAAAGTATTTGTACAGTCTGCAAATGGCAATGAAGAAACACAAATGTCGCAGATTGAAAACATGATAAACCGGGGTGTCGATGTTCGTGTCATTATTCCGTATAACGGTCAGGTATTAAGTAACGTTGTAAg > 1:100732‑M2/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |