| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,888,435 | Δ3,155 bp | [tnaC]–tnaB | [tnaC], tnaA, tnaB | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3888435 | 3891589 | 3155 | 60 [0] | [0] 60 | [tnaC]–tnaB | [tnaC],tnaA,tnaB |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3888434 | 0 (0.000) | 60 (0.920) | 55/478 | 0.0 | 100% | intergenic (+242/‑1) | mnmE/tnaC | 5‑carboxymethylaminomethyluridine‑tRNA synthase GTPase subunit/tnaAB operon leader peptide |
| ? | NC_000913 | 3891590 = | 0 (0.000) | intergenic (+107/‑25) | tnaB/mdtL | tryptophan:H(+) symporter TnaB/efflux pump MdtL | |||||
GCTCGCAAGAAGTTTCCCAATCAGATGTTCACGGTCTGGGGCGGCAATCTTATTCCGGCGATTGTCATTCTCTTTGGTATAACCGTGATTTTGTGCTGGTTCGGCAACGTCTTTAACGTGTTACCTAAATTTGGCTAAATCCTTCAAGAAGCCAGCCATTCGCTGGCTTCTTGCCTCTCAGGAAATCACTTATGTCCAAATGGCAACTCGCCTGATCCTCCTTCACCACGTATGCTTTGCGTCACCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGC‑TTTTTGATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGCCGGTCGCCATACC > NC_000913/3891346‑3891832 | aaccgcgcttacgaagccgcattctgactgtcagattcggcttcgcttcattgttaccactcctgttattcctcaaccctttttttaaacattaaaattcttacgtaatttataatcattaaaaaaagcatttaatattgctccccgaacgattgtgattcgattcacatttaaacaatttcagaatagacaaaaactctgagtgtaataatgtagcctcgtgtcttgcgaggataagtgcattCCTTAc < 2:13077‑M2/6‑1 (MQ=255) 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gtcttgcgaggataagtgcattCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGC‑TTTTTGATTTGTAGttt > 1:414192‑M2/23‑73 (MQ=255) ttgcgaggataagtgcattCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGC‑TTTTTGATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGcc < 1:493217‑M2/231‑1 (MQ=255) gcgaggataagtgcattCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGC‑TTTTTGATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTCAAGTGGCCGATcgttcagggagaccgctggt > 1:255855‑M2/18‑243 (MQ=255) ggaggataagtgcattCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGC‑TTTTTGATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGCCGGTc < 2:41686‑M2/235‑1 (MQ=255) cgaggataagtgcattCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGC‑TTTTTGATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTCCTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGCCGGTc < 2:271919‑M2/235‑1 (MQ=255) ggtgcatcCCTTACGACCAGGACGCTTTACCNCA‑GTCCCCCTTTTTTGATTGTTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTACCCCGCCGGGATTGATATGTTCCTCGTTGGTTTCCCGCGCACCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGGTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGCCGGTCGCCATAcc < 2:255855‑M2/243‑1 (MQ=255) | GCTCGCAAGAAGTTTCCCAATCAGATGTTCACGGTCTGGGGCGGCAATCTTATTCCGGCGATTGTCATTCTCTTTGGTATAACCGTGATTTTGTGCTGGTTCGGCAACGTCTTTAACGTGTTACCTAAATTTGGCTAAATCCTTCAAGAAGCCAGCCATTCGCTGGCTTCTTGCCTCTCAGGAAATCACTTATGTCCAAATGGCAACTCGCCTGATCCTCCTTCACCACGTATGCTTTGCGTCACCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGC‑TTTTTGATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGCCGGTCGCCATACC > NC_000913/3891346‑3891832 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |