| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,888,435 | Δ3,155 bp | [tnaC]–tnaB | [tnaC], tnaA, tnaB | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3888435 | 3891589 | 3155 | 60 [0] | [0] 60 | [tnaC]–tnaB | [tnaC],tnaA,tnaB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3888434 | 0 (0.000) | 60 (0.920) | 55/478 | 0.0 | 100% | intergenic (+242/‑1) | mnmE/tnaC | 5‑carboxymethylaminomethyluridine‑tRNA synthase GTPase subunit/tnaAB operon leader peptide |
| ? | NC_000913 | 3891590 = | 0 (0.000) | intergenic (+107/‑25) | tnaB/mdtL | tryptophan:H(+) symporter TnaB/efflux pump MdtL | |||||
AACCGCGCTTACGAAGCCGCATTCTGACTGTCAGATGCGGCTTCGCTTCATTGTTACCACTCCTGTTATTCCTCAACCCTTTTTTTAAACATTAAAATTCTTACGTAATTTATAATCTTTAAAAAAAGCATTTAATATTGCTCCCCGAACGATTGTGATTCGATTCACATTTAAACAATTTCAGAATAGACAAAAACTCTGAGTGTAATAATGTAGCCTCGTGTCTTGCGAGGATAAGTGCATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3888191‑3888434‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTT‑GATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGCCGGTCGCCATACC > NC_000913/3891590‑3891832 AACCGCGCTTACGAAGCCGCATTCTGACTGTCAGATTCGGCTTCGCTTCATTGTTACCACTCCTGTTATTCCTCAACCCTTTTTTTAAACATTAAAATTCTTACGTAATTTATAATCATTAAAAAAAGCATTTAATATTGCTCCCCGAACGATTGTGATTCGATTCACATTTAAACAATTTCAGAATAGACAAAAACTCTGAGTGTAATAATGTAGCCTCGTGTCTTGCGAGGATAAGTGCATTCCTTAC < 2:13077/250‑1 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CAGATGCTTCTTCGCTTCCTTATCACCACTCCTGTTATTCCTCAACCCTTTTTTTAAACATTAAAATTCTTACGTAATTTATAATCTTTAAAAAAAGCATTTAATATTGCACCCCGAACGAGTGTTATTCGATTCACATTTAAACAATTTCAGAATATACAAAAACTCTGAGTGTAATAAGGTATCCTCGTGTGTCGCGAGGATAAGTGCATTCCTTACTACCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTT < 1:311716/251‑1 GATGCGGCTTCGCTTCATTGTTACCACTCCTGTTATTCCTCAACCCTTTTTTTAAACATTAAAATTCTTACGTAATTTATAATCTTTAAAAAAAGCATTTAATATTGCTCCCCGAACGATTGTGATTCGATTCACATTTAAACAATTTCAGAATAGACAAAAACTCTGAGTGTAATAATGTAGCCTCGTGTCTTGCGAGGATAAGTGCATTCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTT‑G < 1:364790/251‑1 ATGCGGCTTCGCTTCATTGTTACCACTCCTGTTATTCCTCAACCCTTTTTTTAAACATTAAAATTCTTACGTAATTTATAATCTTTAAAAAAAGCATTTAATATTGCTCCCCGAACGATTGTGATTCGATTCACATTTAAACAATTTCAGAATAGACAAAAACTCTGAGTGTAATAATGTAGCCTCGTGTCTTGCGAGGATAAGTGCATTCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTT‑GA < 2:462645/251‑1 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TTTTTTAAACATTAAAATTCTTACGTAATTTATAATCTTTAAAAAAAGCATTTAATATTGCTCCCCGAACGATTGTGATTCGATTCACATTTAAACAATTTCAGAATAGACAAAAACTCTGAGTGTAATAATGTAGCCTCGTGTCTTGCGAGGATAAGTGCATTCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTT‑GATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATAT > 1:205330/1‑251 TTAAACATTAAAATTCTTACGTAATTTATAATCTTTAAAAAAAGCATTTAATATTGCTCCCCGAACGATTGTGATTCGATTCACATTTAAACAATTTCAGAATAGACAAAAACTCTGAGTGTAATAATGTAGCCTCGTGTCTTGCGAGGATAAGTGCATTCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTT‑GATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTAC > 2:115451/1‑251 ATTAAAATTCTTACGTAATTTATAATCTTTAAAAAAAGCATTTAATATTGCTCCCCGAACGATTGTGATCCGATTCACATTTAAACAATTTCAGAATAGACAAAAACTCTGAGTGTAATAATGTAGCCTCGTGTCTTGCGAGGATAAGTGCATTCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTT‑GATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTT > 1:485034/1‑251 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gggAATAATGTAGCCGCTTGTCTTGCGAGGATAAGTGCATTCCTTACTATCAGGCCGCTTTAGCCGTTGTCCCGCTTTTT‑TATTTGGAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCTTCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGGATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGC < 2:396782/248‑1 ATAATGTAGCCTCGTGTCTTGCGAGGATAAGTGCATTCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTT‑GATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGGAAAGTGGCCGAT > 2:493217/1‑251 ATGTAGCCTCGTGTCTTGCGAGGATAAGTGCATTCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTT‑GATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCACTGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTTCGATGTTATTTTCCGGTAAAGTGGCCGGTCGT > 2:269368/1‑251 GTCTTGCGAGGATAAGTGCATTCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCTCTTTTT‑GATTTGTAGTTT < 2:414192/73‑1 GTCTTGCGAGGATAAGTGCATTCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTT‑GATTTGTAGTTT > 1:414192/1‑73 TTGCGAGGATAAGTGCATTCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTT‑GATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGCC < 1:493217/250‑1 GCGAGGATAAGTGCATTCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTT‑GATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTCAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAccgctggt > 1:255855/1‑243 gGAGGATAAGTGCATTCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTT‑GATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGCCGGTC < 2:41686/250‑1 CGAGGATAAGTGCATTCCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTT‑GATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTCCTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGCCGGTC < 2:271919/251‑1 gGTGCATCCCTTACGACCAGGACGCTTTACCNCA‑GTCCCCCTTTTTTGATTGTTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTACCCCGCCGGGATTGATATGTTCCTCGTTGGTTTCCCGCGCACCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGGTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGCCGGTCGCCATACC < 2:255855/250‑1 AACCGCGCTTACGAAGCCGCATTCTGACTGTCAGATGCGGCTTCGCTTCATTGTTACCACTCCTGTTATTCCTCAACCCTTTTTTTAAACATTAAAATTCTTACGTAATTTATAATCTTTAAAAAAAGCATTTAATATTGCTCCCCGAACGATTGTGATTCGATTCACATTTAAACAATTTCAGAATAGACAAAAACTCTGAGTGTAATAATGTAGCCTCGTGTCTTGCGAGGATAAGTGCATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3888191‑3888434‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTT‑GATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGCCGGTCGCCATACC > NC_000913/3891590‑3891832 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |