| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,506,416 | Δ45 bp | coding (245‑289/537 nt) | sutR → | DNA‑binding transcriptional dual regulator SutR |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1506416 | 1506460 | 45 | 37 [0] | [0] 37 | sutR | DNA‑binding transcriptional dual regulator SutR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1506415 | 0 (0.000) | 37 (1.040) | 34/462 | 0.2 | 100% | coding (244/537 nt) | sutR | DNA‑binding transcriptional dual regulator SutR |
| ? | NC_000913 | 1506461 = | 0 (0.000) | coding (290/537 nt) | sutR | DNA‑binding transcriptional dual regulator SutR | |||||
ACGCCAGCAGCGCGGCTGGAGTCTTTCGCGACTGGCAGAAGCGACGGGCGTTTCTAAAGCAATGTTAGGGCAGATTGAGCGTAATGAGTCCAGTCCGACGGTCGCGACATTATGGAAAATTGCCACCGGGTTGAACGTACCATTTTCAACATTTATTTCTCCGCCGCAGTCCGCTACGCCTTCAGTTTATGATCCACAACAGCAGGCGATGGTGATCACTTCGCTGTTTCCTTATGATCCACAACTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCGTAATGGTGGGGAGCAAACCGTACATTTTCATTCCCTCATCCATTA > NC_000913/1506216‑1506695 | catggaaaatctcgctcgctttttatccaccacacttaaacaactacgccagcagcgcggctggagtctttcgcgactggcagaagcgacgggcgtttctaaagcaatgttagggcagattgagcgtaatgagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCt < 1:277101‑M2/6‑1 (MQ=255) atggaaaatctcgctcgctttttatccaccacccttaaacaactacgccagcagcgcggctggagtctttcgcgactggcagaagcgacgggcgtttctaaagcaatgttagggcagattgagcgtaatgagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGctg < 2:195198‑M2/7‑2 (MQ=255) cgctttttatccaccacacttaaacaactacgccagcagcgcggctggagtctttcgcgactggcagaagcgacgggcgtttctaaagcaatgttagggcagattgagcgtaatgagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGAt < 2:2818‑M2/22‑1 (MQ=255) cagcagcgcggctggagtctttcgcgactggcagaagcgacgggcgtttctaaagcaatgttagggcagattgagcgtaatgagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacagttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGAc < 1:370270‑M2/55‑1 (MQ=255) cagcgcggctggagtctttcgcgacaggcagaagcgacgggcgtttctcaagcaatgttagggcagcttgagcgtaatgagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtacccttttcaacatttatttctccgccgcagtacgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGACCACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGcc > 2:322577‑M2/194‑251 (MQ=255) atcgcggctggagactttcgcgactggcagaagcgacgggcgtttctaaagcaatgttagggcagattgagcgtaatgcgtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttggacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGCGCAATAAGCGAATCGACGccc > 2:256747‑M2/193‑251 (MQ=255) agcgcggctggagtctttcgcgactggcagaagcgacgggcgtttctaaagcaatgttagggcagattgagcgtaatgagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGccc > 1:101506‑M2/193‑251 (MQ=255) cgcggctggagtctttcgcgactggcagaagcgacgggcgtttctaaagcaatgttagggcagattgagcgtaatgagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacGCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCa < 1:183753‑M2/61‑1 (MQ=255) gcggctggagtctttcgcgactggcagaagcgacgggcgtttctaaagcaatgttagggcagattgagcgtaatgagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCAt < 2:275363‑M2/62‑1 (MQ=255) cgactggaagaagcgacgggcgtttctaaagcaatgttagggcagattgagcgtaatgagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATCAGCGAATCGACGCCCCGTGAGAAGGGGGTAATCg > 2:274948‑M2/173‑250 (MQ=255) gacgggcgtttctaaagcaatgttagggcagattgagcgtaatgagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATgtcgtcgtc > 1:136388‑M2/159‑250 (MQ=255) gggcgtttctaaagcaatgttagggcagattgagcgtaatgagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgaaacacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTg > 1:110790‑M2/156‑251 (MQ=255) ggcgtttctaaagcaatgttagggcagattgagcgtaatgagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTg > 1:61215‑M2/155‑250 (MQ=255) gcaatgttagggcagattgagcgtaatgagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTg > 1:237239‑M2/143‑250 (MQ=255) ttagggcagattgagcgtaatgagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaacttgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCtgtg > 1:147949‑M2/137‑251 (MQ=255) ggtaatgagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCATTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATg < 2:259654‑M2/130‑1 (MQ=255) gagtccagtccgacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGAc < 1:288125‑M2/136‑1 (MQ=255) gacggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccactacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATtgtg > 2:178428‑M2/105‑251 (MQ=255) acggtcgcgacattatggaaaattgccaccgggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTgg < 1:170609‑M2/148‑1 (MQ=255) ggttgaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACg < 2:61215‑M2/179‑1 (MQ=255) gaacgtaccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCata < 1:277963‑M2/183‑1 (MQ=255) ccattttcaacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCg > 1:129008‑M2/62‑251 (MQ=255) aacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATgtcgtcg < 2:268123‑M2/90‑1 (MQ=255) aacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCGTAAtggtg < 2:41260‑M2/198‑1 (MQ=255) aacatttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatcaacaccTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCGTAAtggtg > 2:54129‑M2/54‑251 (MQ=255) catttatttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCGTAATGGTggg > 1:46795‑M2/52‑251 (MQ=255) ttctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCGTAATGGTGGGGAGCaa > 2:83748‑M2/45‑250 (MQ=255) ctccgccgcagtccgctacgccttcagtttctgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATACGCGAATCGACGCCCCCTGCGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCGTAATGGTGGGGa > 1:348377‑M2/43‑244 (MQ=255) ctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCGTAATGGTGGGGa < 2:348377‑M2/202‑1 (MQ=255) ctccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCGTAATGGTGGGGAGCAAAcc > 1:56880‑M2/43‑251 (MQ=255) tccgccgcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCGTAATGGTGGGGAGCAAACCg > 1:82142‑M2/42‑251 (MQ=255) gcagtccgctacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCGTAATGGTGGGGAGCAAACCGTACAtt < 2:129008‑M2/216‑1 (MQ=255) ccgctacgccttcagtttatgatccgcaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAATGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATCGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCGTAATGGTGGGTAGCAAACCGTCCATTTTCa < 2:179430‑M2/220‑1 (MQ=255) tacgccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGCCGTCACGCATATCTATCGTAATGGTGGGGAGCAAACCGTACATTTTCATTccc > 2:23164‑M2/27‑251 (MQ=255) ccttcagtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCGTAATGGTGGGGAGCAAACCGTACATTTTCATTCCCTCAt < 2:101137‑M2/229‑1 (MQ=255) agtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCGTAATGGTGGGGAGCAAACCGTACATTTTCATTCCCTCATCCAtt > 2:207406‑M2/18‑251 (MQ=255) gtttatgatccacaacTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCGTAATGGTGGGGAGCAAACCGTACATTTTCATTCCCTCATCCATTa < 1:312745‑M2/235‑1 (MQ=255) | ACGCCAGCAGCGCGGCTGGAGTCTTTCGCGACTGGCAGAAGCGACGGGCGTTTCTAAAGCAATGTTAGGGCAGATTGAGCGTAATGAGTCCAGTCCGACGGTCGCGACATTATGGAAAATTGCCACCGGGTTGAACGTACCATTTTCAACATTTATTTCTCCGCCGCAGTCCGCTACGCCTTCAGTTTATGATCCACAACAGCAGGCGATGGTGATCACTTCGCTGTTTCCTTATGATCCACAACTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCGTAATGGTGGGGAGCAAACCGTACATTTTCATTCCCTCATCCATTA > NC_000913/1506216‑1506695 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |