| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,506,416 | Δ45 bp | coding (245‑289/537 nt) | sutR → | DNA‑binding transcriptional dual regulator SutR |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1506416 | 1506460 | 45 | 37 [0] | [0] 37 | sutR | DNA‑binding transcriptional dual regulator SutR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1506415 | 0 (0.000) | 37 (1.040) | 34/462 | 0.2 | 100% | coding (244/537 nt) | sutR | DNA‑binding transcriptional dual regulator SutR |
| ? | NC_000913 | 1506461 = | 0 (0.000) | coding (290/537 nt) | sutR | DNA‑binding transcriptional dual regulator SutR | |||||
CATGGAAAATCTCGCTCGCTTTTTATCCACCACACTTAAACAACTACGCCAGCAGCGCGGCTGGAGTCTTTCGCGACTGGCAGAAGCGACGGGCGTTTCTAAAGCAATGTTAGGGCAGATTGAGCGTAATGAGTCCAGTCCGACGGTCGCGACATTATGGAAAATTGCCACCGGGTTGAACGTACCATTTTCAACATTTATTTCTCCGCCGCAGTCCGCTACGCCTTCAGTTTATGATCCACAACAGCAGGCGATGGTGATCACTTCGCTGTTTCCTTATGATCCACAACTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCG > NC_000913/1506171‑1506650 | cATGGAAAATCTCGCTCGCTTTTTATCCACCACACTTAAACAACTACGCCAGCAGCGCGGCTGGAGTCTTTCGCGACTGGCAGAAGCGACGGGCGTTTCTAAAGCAATGTTAGGGCAGATTGAGCGTAATGAGTCCAGTCCGACGGTCGCGACATTATGGAAAATTGCCACCGGGTTGAACGTACCATTTTCAACATTTATTTCTCCGCCGCAGTCCGCTACGCCTTCAGTTTATGATCCACAACtctgct < 1:277101‑M1/251‑7 (MQ=255) 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1:46795‑M1/1‑51 (MQ=255) ttCTCCGCCGCAGTCCGCTACGCCTTCAGTTTATGATCCACAACtctgctttgaacacttctcgattcagatggcatctggtgcaataagcgaatcgacgccccatgagaagggggtaatcgaacatgtcgtcgtcattgatggacaacttgatctgtgcgttgatggggaatggcagacccttaattgtggggaaggcgttcgatttgctgcagacgtcacgcatatctatcgtaatggtggggagcaa > 2:83748‑M1/1‑44 (MQ=255) ctcCGCCGCAGTCCGCTACGCCTTCAGTTTCTGATCCACAACtctgctttgaacacttctcgattcagatggcatctggtgcaatacgcgaatcgacgccccctgcgaagggggtaatcgaacatgtcgtcgtcattgatggacaacttgatctgtgcgttgatggggaatggcagacccttaattgtggggaaggcgttcgatttgctgcagacgtcacgcatatctatcgtaatggtgggga > 1:348377‑M1/1‑42 (MQ=255) ctcCGCCGCAGTCCGCTACGCCTTCAGTTTATGATCCACAACtctgctttgaacacttctcgattcagatggcatctggtgcaataagcgaatcgacgccccatgagaagggggtaatcgaacatgtcgtcgtcattgatggacaacttgatctgtgcgttgatggggaatggcagacccttaattgtggggaaggcgttcgatttgctgcagacgtcacgcatatctatcgtaatggtggggagcaaacc > 1:56880‑M1/1‑42 (MQ=255) 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CATGGAAAATCTCGCTCGCTTTTTATCCACCACACTTAAACAACTACGCCAGCAGCGCGGCTGGAGTCTTTCGCGACTGGCAGAAGCGACGGGCGTTTCTAAAGCAATGTTAGGGCAGATTGAGCGTAATGAGTCCAGTCCGACGGTCGCGACATTATGGAAAATTGCCACCGGGTTGAACGTACCATTTTCAACATTTATTTCTCCGCCGCAGTCCGCTACGCCTTCAGTTTATGATCCACAACAGCAGGCGATGGTGATCACTTCGCTGTTTCCTTATGATCCACAACTCTGCTTTGAACACTTCTCGATTCAGATGGCATCTGGTGCAATAAGCGAATCGACGCCCCATGAGAAGGGGGTAATCGAACATGTCGTCGTCATTGATGGACAACTTGATCTGTGCGTTGATGGGGAATGGCAGACCCTTAATTGTGGGGAAGGCGTTCGATTTGCTGCAGACGTCACGCATATCTATCG > NC_000913/1506171‑1506650 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |