| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 293,207 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑259/+9) | yagK ← / ← yagL | uncharacterized protein YagK/resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 293207 = | 1 (0.020) | 44 (0.730) | 41/480 | 0.4 | 97.7% | intergenic (‑259/+13) | yagK/yagL | uncharacterized protein YagK/resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
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| * | ? | NC_000913 | = 293211 | 2 (0.030) | 57 (0.950) | 52/480 | 0.2 | 96.5% | intergenic (‑263/+9) | yagK/yagL | uncharacterized protein YagK/resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
| ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
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tacgccagagaaataactggctcgctgctactccatgttgccgggcaacgatggagtccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaatttcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatcttttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTAGCtt > 1:22174‑M1/243‑249 (MQ=255) gTCCTACTGTCTATAGCAGACCGGACAGGGATGCCATACAGGCAGGGTTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATCCTGTTAACAGATTTTAGTTAGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACGGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATTCCAGTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGTAGTTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGTAATTAGCtggatt < 2:393048‑M1/251‑7 (MQ=255) cagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTAGCTTCTGGAAt > 1:489480‑M1/238‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |