| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,252,952 | IS2 (–) +5 bp | coding (42‑46/357 nt) | yhaI → | putative inner membrane protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3186096 = | NA (NA) | 34 (0.930) | 32/488 | 0.2 | 97.1% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3252952 = | 1 (0.030) | coding (42/357 nt) | yhaI | putative inner membrane protein | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3187426 | NA (NA) | 23 (0.630) | 22/488 | 0.6 | 95.8% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3252956 | 1 (0.030) | coding (46/357 nt) | yhaI | putative inner membrane protein | |||||
TCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3187187‑3187426‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATTCCGGGTATTGTGTAAATGCTATTCGTATCTTTCTTTTTCGGATGTTATAAAGGTTTTGATATTTAAGATAAATACATGGTTATTTTTTATAGGTAATTTATATAACGACATTGAAATATTTTAAATAAACATTAGTAAATTATTCATTCATCAACATAATG < NC_000913/3252956‑3252712 TCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAACCGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAACCCAGACGGGTTAACGGCAGCCAAGAACCTTGCAGATGCGTTCGAGCCTTCTAACGAATGGCATCCGCATAGTGCCCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTCATGGGTTAAGTGTTAACAGATGTCTGGGAATATAGGGGCAAATACACAGAGAAACC > 2:228298/1‑250TCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACC < 1:228298/250‑1 AAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCCGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAAC > 1:167301/1‑250 GCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGCCGAA > 1:261528/1‑250 CCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGATCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGTTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCAAAAAAACCTCCCTTTAATTAAAAGTTACGcaa > 2:113947/1‑247 AGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATTCC < 1:334168/251‑1 CGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATATCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATTCCGGG > 1:309319/1‑251 AAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATTCCGGGTATTGTGTAAATGCT > 1:2626/1‑250 CGAATGGCATCCGCATAGTGAGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAAACCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATGAAAAGTGACGAAAGTCTATTCCGGGTATTGTGTAAATGCTATTCGTATCTTTCTTTTTCGGATTTTATAAAGG < 1:38732/251‑1 GAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAG < 1:24186/182‑1 GAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAG > 2:24186/1‑182 AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGTGTAAGTGATAACAGATTTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATTCCGGTTATTGTGTAAATGTTATTCGTATCTTTCTTTTTCGGATGTTATAAAGGTTTTGAGATTGAAGAT < 2:92883/251‑1 ATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATTCCGGGTATTGTGTAAATGCTATTCGTATCTTTCTTTTTCGGATGTTATAAAGGTTTTGATATTTAAGATAAATACATGGTTA < 1:743/251‑1 GCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATTCCGGGTATTGTGTAAATGCTATTCGTATCTTTCTTTTTCGGATGTTATAAAGGTTTTGATATTTAAGATAAATACATGGTTATTTTTTA < 1:154309/251‑1 GCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATTCCGGGTATTGTGTAAATGCTATTCGTATCTTTCTTTTTCGGATGTTATAAAGGTTTTGATATTTAAGATAAATACATGGTTATTTTTTATAGGTAATTTATATA < 2:220051/251‑1 GCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTGTTATTACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATTCCGGGTATTGTGTAAATGCTATTCGTAGCTTTCTTTTTCGGATGTTATAAAGGTTTTGATATTTAAGATAAATACATGGTTATTTTTTATAGGTAATTTATAT < 1:270238/250‑1 GCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGGTAAGGGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAAATTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATTCCGGGTATTGTGTAAATGCTATTCGTATCTTTCTTTTTCGGATGTTATAAAGGTTTTGATATTTAAGATAAATACATGGTTATTTTTTATAGGTAATTTA < 1:88501/247‑1 CGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATTCCGGGTATTGTGTAAATGCTATTCGTATCTTTCTTTTTCGGATGTTATAAAGGTTTTGATATTTAAGATAAATACATGGTTATTTTTTATAGGTAATTTATATAACGACAT < 1:223521/251‑1 tgaGTTAAGAGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATACCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATACCGGGTATAGTGTAAATGCTATTCGTATCTTTCTTTTTCGGATGGTATAAAGGTTTTGATATTTAAGATAAATACATGGTTATTTTTTATAGGTAATTTATATAACGCCATTGAAATATTTT > 2:8162/4‑251 GTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATTCCGGGTATTGTGTAAATGCTATTCGTATCTTTCTTTTTCGGATGTTATAAAGGTTTTGATATTTAAGATAAATACATGGTTATTTTTTATAGGTAATTTATATAACGACATTGAAATATTTTAAATAAAC < 1:46421/251‑1 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TCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3187187‑3187426‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGACAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATTCCGGGTATTGTGTAAATGCTATTCGTATCTTTCTTTTTCGGATGTTATAAAGGTTTTGATATTTAAGATAAATACATGGTTATTTTTTATAGGTAATTTATATAACGACATTGAAATATTTTAAATAAACATTAGTAAATTATTCATTCATCAACATAATG < NC_000913/3252956‑3252712 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |