| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 293,207 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑259/+9) | yagK ← / ← yagL | uncharacterized protein YagK/resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
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gtctaTTAG‑CTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCTTCACAGTCGATAAACTGATACTCAATTTCTTTGCAATCTCAGCCTGAGTAAATCCACCTTTATTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGCAGAAGGCTCTATCCTTGAAGCTGGATGGTAGCTGTAGAt < 2:120905‑M1/295‑1 (MQ=255) gtctaTTAG‑CTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCTTCAAAGTCGATAAACTGATACTCAATTTCTTTGCAATCTCAGCATGAGTAAATCCAACTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCTGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGCAGAAGGCTCTATCCTTGAAGCCGGATGGTAGCTGTAGAt < 1:201732‑M1/295‑1 (MQ=255) ctaTTAG‑CTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCTTCACAGTCGATAAACTGATACTCAATTTCTTTGCAATCTCAGCCTGAGTAAATCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGCAGAAGGCTCTATCCTTGAAGCTGGATGGTAGCTGTAGATaa < 2:361332‑M1/297‑1 (MQ=255) ctaTTAG‑CTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCTTCACAGTCGATAAACTGATACTCAATTTCTTTGCAATCTCAGCCTGAGTAAATCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGCAGAAGGCTCTATCCTTGAAGCTGGATGGTAGCTGTAGATaa < 1:650282‑M1/297‑1 (MQ=255) ctaTTAG‑CTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCTTCACAGTCGATAAACTGATACTCAATTTCTTTGCAATCTCAGCCTGAGTAAATCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGCAGAAGGCCCTATCCTTGAAGCTGGATGGTAGCTGTAGATaa < 2:168659‑M1/297‑1 (MQ=255) taTTAG‑CTTCTGGAAGTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCTTCACAGTTGATAAACTGATACTCAATTTCTTTGCAATCTCAGCCTGAGTAAATCCACCTTTCTTAAGTGTTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTGCCCTTCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTGAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACAAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGCAGAAGGCTCTATCCTTGAAGCTGGATGGTAGCTGTAGAt > 1:467156‑M1/3‑297 (MQ=255) aTTAG‑Ctggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaacatccgggcgaactggcgt < 2:633707‑M1/300‑295 (MQ=255) tAG‑CTTCTGGAAGTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCGTCACAGTCGATAAACTGATACTCAATTTCTTTGCAATCTCAGCCTGAGTAAATCCACCTTTCTTAAGTATTGGGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTGCGTCCGAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGACTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGTAGAAGGCTCTATTCTTGAAGc < 1:523569/276‑1 (MQ=255) cTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCTTCACAGTCGATAAACTGATACTCAATTTCTTTGCAATCTCAGCCTGAGTAAATCCACCTTTCTTACGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGTTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGAAGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGCAGAAGGCTCTATCATTGAAGCTGGATGGTAGCTGTAGATAAACAttt > 2:86208/1‑299 (MQ=255) | TATGTACTCCATGAGTACCTTGATATGTTTTCATAATATATACCTGTATTTGGTCCTA‑CGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAG‑CTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCTTCACAGTCGATAAACTGATACTCAATTTCTTTGCAATCTCAGCCTGAGTAAATCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGCAGAAGGCTCTATCCTTGAAGCTGGATGGTAGCTGTAGATAAACATTTC > NC_000913/292915‑293510 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |