| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 293,207 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑259/+9) | yagK ← / ← yagL | uncharacterized protein YagK/resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 293207 = | 1 (0.010) | 133 (1.560) | 76/588 | 0.0 | 99.2% | intergenic (‑259/+13) | yagK/yagL | uncharacterized protein YagK/resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
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| * | ? | NC_000913 | = 293211 | 0 (0.000) | 108 (1.270) | 64/588 | 0.1 | 100% | intergenic (‑263/+9) | yagK/yagL | uncharacterized protein YagK/resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
| ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CTCCATGAGTACCTTGATATGTTTTCATAATATATACCTGTATTTGGTCCTA‑CGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGC‑t‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/292921‑293211‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATT‑TGCCCCTATATTTCCAG‑ACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCGAACTGGCGT < NC_000913/382590‑382297 CTCCATGAGTACCTTGATATGTTTTCATAATATATACCTGTATTTGGTCCTA‑CGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATGCAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTAATCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAAAATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCAAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCGATTAGC‑TGGATT‑TGC > 2:31377/1‑300CTCCATGAGTACCTTGATATGTTTTCATAATATATACCTGTATTTGGTCCTA‑CGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGC‑TGGATT‑TGC > 2:259593/1‑300CTCCATGAGTACCTTGATATGTTTTCATAATATATACCTGTATTTGGTCCTA‑CGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATAAAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATGCAGGTCGTAAGAGTACACAATGCCATTATCTACTCCCTATCAAACATCTACATTTGAGAAGAAAGTAGCCCAAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTAATCTGTAATTAGT‑TGGATT‑TGC > 2:31529/1‑300 CATGAGTACCTTGATATGTTTTCATAATATATACCTGTATTTGGTCCTA‑CGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGC‑TGGATT‑TGCCCC > 2:565614/1‑300 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AGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGC‑TGGATT‑TGCCCCTATATTTCCAG‑ACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTATGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGNCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGC > 1:147366/1‑300 GCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGC‑TGGATT‑TGCCCCTATATTTCCAG‑ACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGT > 1:96352/1‑300 CCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGC‑TGGATT‑TGCCCCTATATTTCCAG‑ACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTATGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTT > 2:29512/1‑300 AGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGC‑TGGATT‑TGCCCCTATATTTCCAG‑ACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCTTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTC < 1:565614/297‑1 AGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGC‑TGGATT‑TGCCCCTATATTTCCAG‑ACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTC < 1:565916/297‑1 CCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGC‑TGGATT‑TGCCCCTATATTTCCAG‑ACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTC > 1:697745/1‑298 CCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGC‑TGGATT‑TGCCCCTATATTTCCAG‑ACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTT > 1:697314/1‑297 AAGTTACTCTGCAATTAGC‑TGGATT‑TGCCCATATATTTCCAG‑AAATCTGTTATCAATTAACCCATTACAAGCCCGCTGCAGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATCACCCATCGCACTATGCGGATGCCAGTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGATATTCCGTTACTCTCAGGACTCCGCACCACCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCAAACATC > 2:441716/1‑298 ATTAGC‑TGGATT‑TGCCCCTATATTTCCAG‑ACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCGAACTGGCGT < 2:633707/300‑1 CTCCATGAGTACCTTGATATGTTTTCATAATATATACCTGTATTTGGTCCTA‑CGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGC‑t‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/292921‑293211‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATT‑TGCCCCTATATTTCCAG‑ACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCGAACTGGCGT < NC_000913/382590‑382297 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |