| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 293,207 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑259/+9) | yagK ← / ← yagL | uncharacterized protein YagK/resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 293211 | 0 (0.000) | 108 (1.270) | 64/588 | 0.1 | 100% | intergenic (‑263/+9) | yagK/yagL | uncharacterized protein YagK/resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
| ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
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GGATATGTACTCCATGAGTACCTTGATATGTTTTCATAATATATACCTGTATTTGGTCCTACGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCTTCACAGTCGATAAACTGATACTCAATTTCTTTGCAATCTCAGCCTGAGTAAATCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGCAGAAGGCTCTATCCTTGAAGCTGGATGGTAGCTGTAGATAAAC > NC_000913/292912‑293505 | aacaacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcccggtattgcttacaccagagaaatagccggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggataccgtcatccccggttcaaagctcggctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtaccccgtctgcgtttctccggcccgaagacatcaatcatctgttctccaattactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattgtttgtctggagagtcagggggccagtctaTTAg > 2:81768‑M1/296‑299 (MQ=255) 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GGATATGTACTCCATGAGTACCTTGATATGTTTTCATAATATATACCTGTATTTGGTCCTACGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCTTCACAGTCGATAAACTGATACTCAATTTCTTTGCAATCTCAGCCTGAGTAAATCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGCAGAAGGCTCTATCCTTGAAGCTGGATGGTAGCTGTAGATAAAC > NC_000913/292912‑293505 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |