| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012971 | = 3644070 | 103 (1.020) | 7 (0.070) | 7/580 | 7.4 | 6.8% | coding (2645/4851 nt) | ECD_RS18090 | YadA‑like family protein |
| ? | NC_012971 | 3644368 = | 90 (0.910) | coding (2943/4851 nt) | ECD_RS18090 | YadA‑like family protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTACACCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGGTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCACTCTTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTACAACAACGTCGGTGACGCCCTGGATGCGCTTGATGATAACGCCCTGCTGTGGGATGAGACTGCCAATGGCGGTGCTGGAGCCTACA‑ATGCCAGCCATGACGGTAAAGCCAGCATCATCACTAATGTCGCTAATGGCAGTATTAGTGAGGACAGTACCGATGCAGTGAACGGTTCTCAGTTGAATGCGACGAATATGATGATTGAGCAGAACACCCAAATTATCAATCAGCTCGCTGGTAACACCGACGCAACCTATATCCAAGAAAACGGTGC > NC_012971/3644071‑3644664 | gTACACCATTGCTAATNCTGATTACGATAATGTCGNTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCACTCTTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCGACGCCGACGGCACNATCACCGCACCGACtt < 1:661051/299‑1 (MQ=255)gTACACCATTGCTAATNCTGATTACGATAATGTCGNTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCACTCTTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACNATCACCGCACCGACtt < 1:662004/299‑1 (MQ=255) acacCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGGTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCACTCTTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAATGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTaca > 2:25866/1‑300 (MQ=255) cacCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGGTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCACTCTTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCAACGCACCGACTTacac > 2:793698/1‑300 (MQ=255) acaaTTGCTAATGCTGATTACGGTAATGTCGGTGATGCCCTTAAGGCTATCGATACCACCCTTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCTGGGGAAGAGGGTGCGTTGAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCAAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCATCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATGCCATTAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTacac < 2:454438/296‑1 (MQ=255) acCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGTTGATACCCGGAATGCTATCGATACCACTCTTGACGACACTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTacac < 2:82276/299‑1 (MQ=255) acCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGGTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCACTCTTGACGACGCTCTGCTNTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTacac < 1:572199/299‑1 (MQ=255) gCTAATGCTGATTACGATAATGTCGGTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCACTCTTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGc > 1:252369/1‑299 (MQ=255) gATAATGTCGGTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCACTCTTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTacaac < 1:794032/300‑1 (MQ=255) aTAATGTCGGTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCACTCTTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAATTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTacaac < 1:386164/299‑1 (MQ=255) tAATGTCGGTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCACTCTTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTAcaacaa < 1:14024/300‑1 (MQ=255) gTCGGTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCACTCTTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCAACAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTCAAACAACgcc > 2:759355/1‑298 (MQ=255) gTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCACTCTTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCCTCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTATAACAACGTCGGt > 2:538802/1‑299 (MQ=255) 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ctctTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTACAACAACGTCGGTGACGCCCTGGATGCGCTTGATGATAAc > 1:336540/1‑299 (MQ=255) ctTGACGACGCTCTGCTCTGGGATTCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTACAACAACGTCGGTGACGCCCTGGATGCGCTTGATGATAACGc > 1:105572/1‑299 (MQ=255) ctTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACCCCGAGTACAACAACGTCGGTGACACACGGGATGCGCTTGATGATaaagc > 2:527211/1‑296 (MQ=255) ctTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGAAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCAACGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTACAACAACGTCGGTGACGCACTGGGTGCGCTTGATGATAACGca > 2:529404/1‑299 (MQ=255) acgCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATCAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTACAACAACGTAGGTGAAGCCCTGGATGCGCTTGATGATAACGCCctg > 1:690415/1‑296 (MQ=255) acgCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCAACAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTACAACAACGTCGGTGACGCCATGGATGCGCTTGATGATAACGCCctg > 1:690408/1‑296 (MQ=255) gctctgctctGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTACAACAACGTCGGTGACGCCCCGGATGCGATTGCTGATAACGCActgctat > 2:275761/1‑296 (MQ=255) gctctgctctGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCAACATCAACGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTACAACACAGTCGGTGCCGCCCTGGATGCGCTtgctga > 2:275806/1‑284 (MQ=255) tctgctctgGGATGTGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTACAACAACGTCGGTGACGCCCTGGATGCGCTTGATGATAACGCCCTGCTGTGGGa < 2:364610/300‑1 (MQ=255) tctgctctgGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTACAACAACGTCGGTGACGCCCTGGATGCGCTTGATGACAACGCCCTGCTGTGGGa < 2:281827/300‑1 (MQ=255) gctctgGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAGTCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATACGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACAGCACCATCAACGCACCGACTTACACCATAGCGAACACCAAGTAAAAAGACGTCGGTGACGCCCTGGATGCGCTTGCTGATCACGCCCTGCTGTggggt > 2:334418/1‑296 (MQ=255) gctctgGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTACAACAACGTCGGTGACGCCCTGGATGCGCTTGATGATAACGCCCTGCTGTGGGATga > 2:186609/1‑300 (MQ=255) gctctgGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTACAACAACGTCGGTGACGCCCTGGATGCGCTTGATGATAACGCCCTGCTGTGGGATga < 1:45295/300‑1 (MQ=255) gctctgGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTACAACAACGTCGGTGACGCCATGGATGCGCTTGATGATAACGCCCCGCTGTGGGATga > 2:90247/1‑300 (MQ=255) gctctgGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCAACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTACAACAACGTCGGTGACGCCCTGGATGCGCTTGATGATAACGCCCTGCTGTGGGATga > 2:662162/1‑300 (MQ=255) 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aCTTACACCATTGCGANCACCGAGTACAACAACGTCGGTGACGCCCTGGATGCGCTTGATGATAACGCCCTGCTGTGGGATGAGACTGCCAATGGCGGTGCTGGAGCCTACA‑ATGCCAGCCATGACGGTAAAGCCAGCATCATCACTAATGTCGCTAATGGCAGTATTAGTGAGGACAGTAGCGATGCAGTGAACGGTTCTCAGTTGAATGCGACGAATATGATGATTGAGCAGAACACCCAAATTATCAATCAGCTCGCTGGNCCCCCCGACGCAACCTAGNTCCAAGaaaa > 1:663161/1‑293 (MQ=255) | GTACACCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGGTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCACTCTTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGACTTACACCATTGCGAACACCGAGTACAACAACGTCGGTGACGCCCTGGATGCGCTTGATGATAACGCCCTGCTGTGGGATGAGACTGCCAATGGCGGTGCTGGAGCCTACA‑ATGCCAGCCATGACGGTAAAGCCAGCATCATCACTAATGTCGCTAATGGCAGTATTAGTGAGGACAGTACCGATGCAGTGAACGGTTCTCAGTTGAATGCGACGAATATGATGATTGAGCAGAACACCCAAATTATCAATCAGCTCGCTGGTAACACCGACGCAACCTATATCCAAGAAAACGGTGC > NC_012971/3644071‑3644664 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |