| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012971 | = 3644070 | 103 (1.020) | 7 (0.070) | 7/580 | 7.4 | 6.8% | coding (2645/4851 nt) | ECD_RS18090 | YadA‑like family protein |
| ? | NC_012971 | 3644368 = | 90 (0.910) | coding (2943/4851 nt) | ECD_RS18090 | YadA‑like family protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TACAAAATCGGTGAAACAAATTATTATAACGTCGGCGATGCACTGGCTGCGATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTACACCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGGTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCA‑CTCTTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGAC > NC_012971/3643772‑3644367 | tACAAAATCGGTGAAACAAATTATTATAACGTCGGCGATGCACTGGCTGCGATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACg < 1:146391/300‑1 (MQ=255) aaTCGGTGAAACAAATTGTTATAACGTCGGCGATGCACTGGCTGCGATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCTGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTacac < 1:262880/300‑1 (MQ=255) aaTCGGTGAAACAAATTATTATAACTTCGGCGATGCACTGGCTGCGATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTacac < 2:272873/300‑1 (MQ=255) aaTCGGTGAAACAAATTATTATAACGTCGGCGATGCACTGGCTGCGATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGNTGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTacac < 2:584003/300‑1 (MQ=255) aaTCGGTGAAACAAATTATTATAACGTCGGCGATGCACTGGCTGCGATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTacac < 2:135095/300‑1 (MQ=255) aaTCGGGGAAACAAATTATTATAACGTCGGCGATGCACTGGCTGCGATTAACTCCTCATTTAGTACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTacac < 2:36521/300‑1 (MQ=255) aTCGTTGAAACACATCATTACAACTTCTGCGATGCATTGGCTGCGGTGAACTCCTCATTTAGCACGTCGCTCGGCGATGCGCTGTTGTGGGATGCAACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCGGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCATGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGTTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCATCATCACTGCGCCGACGTacac < 2:143192/299‑1 (MQ=255) aTCGTTGAAACAAATTATTATAACGTCGGCGATGCACTGGCTGCGATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTACAcc < 2:715218/300‑1 (MQ=255) gAAACAAATTATTATAACGTCGGCGATGCACTGGCTGCGATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCACCGACTTACACCATTGc > 2:519882/1‑299 (MQ=255) aaaCAAATTATTATAACGTCGGCGATGCACTGGCTGCGATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTACACCATTGCTa > 1:82276/1‑300 (MQ=255) aaaTTATTATAACGTCGGCGATGCACTGGCTGCGATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTACACCATTGCTAATGc < 1:637013/300‑1 (MQ=255) attatAACGTCGGCGATGCACTGGCTGCGATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTNATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTACACCATTGCTAATGTTGAt > 1:589347/1‑299 (MQ=255) aaCGTCGGCGATGCACTGGCTGCGATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTACACCATTGCTAATGCTGATTACGAt < 1:317438/300‑1 (MQ=255) 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tGGCTGCGATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTACACCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGGTGATGccc < 1:320049/300‑1 (MQ=255) gCGATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTACACCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGGTGATGCCCTGAAt < 1:483865/300‑1 (MQ=255) gATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTACACCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGTTGATGCCCTGAATGc < 1:51529/300‑1 (MQ=255) gATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTACACCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGGTGATGCCCTGAATGc < 1:490765/300‑1 (MQ=255) gATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGGCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGATGTACACCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGGTGATGCCCTGAATGc < 2:219930/300‑1 (MQ=255) gATTAACTCCTCATTGAGCACTTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGTGATGCCACCGCAGGGAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCGAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACTGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTTGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACTGCACCATCACTGCGCCGACGTACACCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGTTGATGCCCTGAATGc < 2:219940/300‑1 (MQ=255) 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tctctcGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCTGGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACTGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTACACCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGGTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCA‑CTCTTgacgac < 2:277490/300‑1 (MQ=255) tctctcGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTACACCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGGTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCA‑CTCTTgacgac > 1:281827/1‑300 (MQ=255) tcGGTGATGCTCGGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTACACCATTGc < 2:120293/235‑1 (MQ=255) 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TACAAAATCGGTGAAACAAATTATTATAACGTCGGCGATGCACTGGCTGCGATTAACTCCTCATTTAGCACGTCTCTCGGCGATGCTCTGCTTTGGGATGCCACCGCAGGTAAATTCAGTGCCAAACACGGTACTAATGGTGACGCAAGCGTGATCACTGATGTCGCAGATGGTGAAATTTCAGACTCCAGTTCTGACGCAGTAAACGGCTCACAACTCCACGGCGTGAGCAGTTATGTTGTTGATGCGCTGGGGGGTGGTGCCGAAGTCAATGCAGACGGCACCATCACTGCGCCGACGTACACCATTGCTAATGCTGATTACGATAATGTCGGTGATGCCCTGAATGCTATCGATACCA‑CTCTTGACGACGCTCTGCTCTGGGATGCGGACGCCGGTGAAAATGGTGCATTTAGCGCCGCTCACGGAAAAGATAAAACTGCCAGTGTAATCACTAACGTCGCTAACGGTGCAATCTCTGCTGCCAGCAGCGACGCGATTAACGGCTCACAACTCTATACCACCAATAAGTACATCGCTGATGCGCTGGGTGGTGACGCAGAAGTCAACGCCGACGGCACCATCACCGCACCGAC > NC_012971/3643772‑3644367 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |