| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 4,069,146 | IS1 (–) +9 bp | coding (123‑131/2037 nt) | yihQ ← | sulfoquinovosidase |
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| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 100 (0.940) | 75/598 | 0.1 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4069154 | 0 (0.000) | coding (123/2037 nt) | yihQ | sulfoquinovosidase | |||||
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
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cGCTATACCTGAGCCAggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgacgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggtgacagcaggctcataagacgccccagtgtcgccatag > 2:762921‑M2/1‑16 (MQ=255) cGCTATACCTGAGCCAggtaatgactacaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggtgacagcaggctcataagacgccccagcgtcgccatag < 1:801413‑M2/300‑285 (MQ=255) cTAGACCTTAGCCAgggaatgactctaacttagtgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggttacagcaggctcataagacgccccagcgtcgccatagtg > 2:85897‑M2/1‑14 (MQ=255) ccCCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGNGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTCGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGNTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAATGTTc > 2:690302‑M2/3‑300 (MQ=255) ccCCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAATGTTc > 2:297085‑M2/3‑300 (MQ=255) ccCCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCATTTAGCGAGTGAAATGTTc > 1:87566‑M2/3‑300 (MQ=255) ccCCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTAAAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTCAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAATGTTc > 2:548146‑M2/3‑300 (MQ=255) aCCTGAGCCAggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaacacgtcaaagggtgacagcaggctcataagacgccccagcgtcgccatagtgcgtt < 1:860197‑M2/300‑291 (MQ=255) aGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAATGTTCTTCAAt > 1:193877/1‑300 (MQ=255) | GATCGAAGTAGGAAAACTGTTCGCCGCAGCCGTAGATATGGTCCTCTGGTTGAGCGGCAAGGCGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAATGTTCTTCAAT > NC_000913/4068856‑4069449 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |