| Predicted mutation | ||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 100 (0.940) | 75/598 | 0.1 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
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Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
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AGTTGGCAGCATCACCCCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAG > 1:445757/1‑300 GTTGGCAGCATCACCCCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTNATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGC > 1:582533/1‑300 CATCACCCCTTAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATATAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAA < 1:148779/300‑1 CATCACCCCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAA > 1:288125/1‑300 CCCCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGNGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTCGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGNTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAATGTTC > 2:690302/1‑300 CCCCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAATGTTC > 1:87726/1‑300 CCCCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAATGTTC > 2:297085/1‑300 CCCCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCATTTAGCGAGTGAAATGTTC > 1:87566/1‑300 CCCCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTAAAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTCAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAATGTTC > 2:548146/1‑300 TCGTGTTGAGGCCAACGCCCATAATGCGGGCTGTTGCCCGGCATCCAACGCCATTCATGGCCATATCAATGATTTTCTGGTGCGTACCGGGTTGAGAAGCGGTGTAAGTGAACTGCAGTTGCCATGTTTTACGGCAGTGAGAGCAGAGATAGCGCTGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3583720‑3583428‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAATGTTC > NC_000913/4069146‑4069443 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |