| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 4,069,146 | IS1 (–) +9 bp | coding (123‑131/2037 nt) | yihQ ← | sulfoquinovosidase |
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Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
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cGCTATACCTG‑AGCCAggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtaaaagggtgacagcaggctcataaggcgccccagcgtcgccatag < 1:213255‑M2/300‑285 (MQ=255) cTATACCTG‑AGCCAggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggtgacagcaggctcataagacgccccagcgtcgccatagtg > 1:384635‑M2/1‑14 (MQ=255) cTAGACCTT‑AGCCAgggaatgactctaacttagtgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggttacagcaggctcataagacgccccagcgtcgccatagtg > 2:85897‑M2/1‑14 (MQ=255) taCCTG‑AGCCAggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggtgacagcaggctcataagacgccccagcgtcgccatagtgcgt > 1:785509‑M2/1‑11 (MQ=255) ccCCTG‑AGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGNGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTCGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGNTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAATGTTc > 2:690302‑M2/3‑300 (MQ=255) ccCCTG‑AGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTACCTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAATGTTc > 1:457819‑M2/3‑300 (MQ=255) ccCCTG‑AGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAATGTTc > 2:297085‑M2/3‑300 (MQ=255) ccCCTG‑AGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCATTTAGCGAGTGAAATGTTc > 1:87566‑M2/3‑300 (MQ=255) ccTG‑AGCCAggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggtgacagcaggctcataagacgccccagcgtcgccatagtgcgttc > 1:116490‑M2/1‑9 (MQ=255) | TGCCACGCAGATCGAAGTAGGAAAACTGTTCGCCGCAGCCGTAGATATGGTCCTCTGGTTGAGCGGCAAGGCGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTG‑AGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAGGGTAAAACTGTCGTTATTCTGATGAAATTGAAAATCTAATAACTGTGGACGTGGCGTATCCATAACTAATCTCCATAGAGTTGAGAACGAGATTGTTGCCTTCCTGTTATTACAGGCTTATGTAAAATGATTCTCATAAAACTGATATATAAAAACTTTACAGAAGCTGAGCTGTTTTTAACTTAATAAATTGAAGATACATAATGTTGCCTTTAGCGAGTGAAATGTTCTT > NC_000913/4068847‑4069445 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |