Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 3,077,568 | Δ1,832 bp | [cmtA]–cmtB | [cmtA], cmtB |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 3077568 | 3079399 | 1832 | 38 [0] | [0] 38 | [cmtA]–cmtB | [cmtA],cmtB |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3077567 | 0 (0.000) | 38 (0.620) | 35/490 | 0.3 | 100% | coding (1293/1389 nt) | cmtA | mannitol‑specific PTS enzyme IICB component CmtA |
? | NC_000913 | 3079400 = | 0 (0.000) | intergenic (‑70/+244) | cmtB/tktA | mannitol‑specific PTS enzyme IIA component CmtB/transketolase 1 |
CGCTGTCAGAAATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3077345‑3077567 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACCTTTTTACCCGAAATGCTAATT > NC_000913/3079400‑3079645 CGCTGTCAGAAATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCCATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑T > 1:270669/1‑251 TGTCAGAAATTACACTCCCCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGCCAGTTCAAATACGCGCAGACGGAAATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGGTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACAGGTGTT‑TTG > 2:153902/1‑250 ACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAAT > 1:262863/1‑251 CACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATTGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATT > 2:103401/1‑251 ATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGGAAACAGTGAATTATTAATTTCTT > 1:387549/1‑250 ATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGCAAACAGTGAATTATTAATTTCTT > 1:366606/1‑250 CATTATCGGTATGTTCTGGCAGTTCAAATGCGCGCAGACGGACATCCCTCTTGCCATCAATAGCAGTAACTTTGGTTTTCATTTTTGCCTCTGTAATCAGGGGTTATGTTCGGTGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCTATATGAGTGGTTTATCCGTCACAAATCAAGTGAGCATGGAAACCTGTGTT‑TTGCAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATA < 2:137148/250‑1 CGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATT < 1:238203/251‑1 AATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAG < 1:61725/250‑1 CTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTACTCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTAT > 2:123721/1‑249 AGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGCGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATAT > 1:139521/1‑250 AAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAATCAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAAC < 1:273264/251‑1 ACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCATCTTTGGTTTTCAGTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCTGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATAGCAGGGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTGATATAACATTGAGTTATAGATATAACAGCAAAT < 2:371989/251‑1 GGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGC > 2:31268/1‑251 ATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGGGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATAT > 2:83396/1‑251 ATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGGTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGGTTTGGATCGCCAATATAGTTTTTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCATGGAAACCGGTGGT‑TTGAAAAAGGTGAATTATTAATTTCTTATTTAACATTGAGTTATAGATATAAAAACAAATGTCAATACGCATA > 2:411116/1‑250 CGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTAAATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTG < 1:263496/251‑1 AGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACAT > 1:86846/1‑250 TTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAAAAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTt > 2:434185/1‑250 TTTCATTTTTTACTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTG < 2:260780/250‑1 TTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGC > 1:97547/1‑251 ATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTACTTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGAATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCC > 2:119337/1‑251 CGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTTATATTTATTGCATATAAATATTTGTGTTCTACAACACGCCTTATC < 2:403066/251‑1 TTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATA > 1:86162/1‑203 TTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATA < 2:86162/203‑1 ATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAAC < 2:9305/251‑1 AAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGG > 2:84596/1‑250 CGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATAT < 1:93535/250‑1 ATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCACGGTAATA > 1:2224/1‑250 AATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGG < 1:411116/251‑1 ATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGT > 2:32641/1‑251 ATCAGTGGTTTAGCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACCTTTT < 2:51784/250‑1 TCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACCTTTTT > 2:361641/1‑250 GTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACCTTTTTACCCGA > 1:312177/1‑250 aTATCCGTCACAAAGAAATTGCGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTCTTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGCAGCGACCTTTTTACCCGAAAT > 2:71732/2‑251 CCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACCTTTTTACCCGAAATGCT > 2:301053/1‑250 CCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGG‑GTTCTTGAAATCAGTGAATTAGTAATTTCTTATATAACATTGATTTATAGATATAACAACAAATGTCAATGCTCAACTCGTGATGCATATTACAAAATTGATAGTTATTGCATATAAAAATTTGTGAACTACAACACGCCTTATCTATTGCTGGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAATCGACCTGTTTACCAGAAATGCT < 2:294268/250‑1 CACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGAT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACCTTTTTACCCGAAATGCAAATT > 2:386347/1‑250 CGCTGTCAGAAATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3077345‑3077567 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTT‑TTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACCTTTTTACCCGAAATGCTAATT > NC_000913/3079400‑3079645 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |