| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,938,983 | IS2 (–) +5 bp | coding (757‑761/993 nt) | rbsR → | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3938983 = | 0 (0.000) | 33 (0.760) | 27/486 | 0.6 | 100% | coding (757/993 nt) | rbsR | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR |
| ? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3938987 | 0 (0.000) | 41 (0.950) | 33/486 | 0.3 | 100% | coding (761/993 nt) | rbsR | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR |
| ? | NC_000913 | = 4499511 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
GATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAACCACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTACTCATCCATCGGATAACCCAGCCGACCCTTCAGCAACAACGATTACAACTTACTCCGATTCTGATGGAACGCGGTTCGGCTTAGATTTACGCTGTCTTTTGA > NC_000913/3938746‑3939237 | cagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGtt < 1:282043‑M1/14‑1 (MQ=255) actggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCa > 1:412691‑M1/228‑251 (MQ=255) gctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctggtctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatagtggttttctggagattcagggggccagtctaGTGTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAg > 2:289201‑M1/217‑249 (MQ=255) atgctatgtctctcggcaactagggagtccctcattcccggttcaaacctctgctgaacaattgcgatcttttcctgcgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatcttttctccaatgacgagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGTCAGAGTtacagtttc > 2:257627‑M1/214‑246 (MQ=255) 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ccGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgct < 1:195367‑M1/249‑59 (MQ=255) tcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaacaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGAAATCGCGGTGATTGGCTATGACGat < 2:169354‑M1/69‑1 (MQ=255) ccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATc > 1:190583‑M1/179‑250 (MQ=255) ccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCg < 2:8236‑M1/73‑1 (MQ=255) cggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtccgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcctctgttctccaatgactagtctacacaatagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggcaagtctaGTTTCCCAGGAGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCTGTGCTTGGATCTAACGATATCGAAc < 2:211881‑M1/76‑1 (MQ=255) gTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCGATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagc < 1:55302‑M1/251‑83 (MQ=255) 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GATAAAGGTCATACCCGTATCGCCTGTATTACCGGCCCGCTGGATAAAACTCCGGCGCGCCTGCGGTTGGAAGGTTATCGGGCGGCGATGAAACGTGCGGGTCTCAACATTCCTGATGGCTATGAAGTCACTGGTGATTTTGAATTTAACGGCGGGTTTGACGCTATGCGCCAACTGCTATCACATCCGCTGCGTCCTCAGGCCGTCTTTACCGGAAATGACGCTATGGCTGTTGGCGTTTACCAGGCGTTATATCAGGCAGAGTTACAGGTTCCGCAGGATATCGCGGTGATTGGCTATGACGATATCGAACTGGCAAGCTTTATGACGCCACCATTAACCACTATCCACCAACCGAAAGATGAACTGGGGGAGCTGGCGATTGATGTACTCATCCATCGGATAACCCAGCCGACCCTTCAGCAACAACGATTACAACTTACTCCGATTCTGATGGAACGCGGTTCGGCTTAGATTTACGCTGTCTTTTGA > NC_000913/3938746‑3939237 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |