| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,942,765 | Δ8 bp | noncoding (70‑77/206 nt) | gcvB → | small regulatory RNA GcvB |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2942765 | 2942772 | 8 | 34 [0] | [0] 34 | gcvB | small regulatory RNA GcvB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2942764 | 0 (0.000) | 34 (0.480) | 31/480 | 0.9 | 100% | noncoding (69/206 nt) | gcvB | small regulatory RNA GcvB |
| ? | NC_000913 | 2942773 = | 0 (0.000) | noncoding (78/206 nt) | gcvB | small regulatory RNA GcvB | |||||
GGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTA > NC_000913/2942520‑2943008 | ggCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTACTCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAAAACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGTGCCGGAACGAAAAGCTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGCACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttg > 2:552553‑M1/1‑245 (MQ=255) cAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgttt > 2:318282‑M1/1‑240 (MQ=255) gTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTTATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACTCTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTGTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGACCTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtatgcaattggt < 2:459340‑M1/251‑21 (MQ=255) gtAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTAGAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatgg < 1:91582‑M1/251‑39 (MQ=255) aaTCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggt < 1:602485‑M1/250‑40 (MQ=255) aTCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGACAAGTTTTATCGGAATTCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcactttgtctgctattcagaccatggt > 2:519757‑M1/1‑210 (MQ=255) aCATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctac < 1:318282‑M1/251‑51 (MQ=255) ggCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttt > 2:231804‑M1/1‑197 (MQ=255) tGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctg < 2:330120‑M1/250‑67 (MQ=255) gTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAACTTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGTAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAAATTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaactggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcactttctgtacat > 2:507075‑M1/1‑180 (MQ=255) aaTGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttac < 2:145773‑M1/251‑76 (MQ=255) tCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgat > 1:393269‑M1/1‑157 (MQ=255) cTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatgtagcaccgc > 1:407948‑M1/1‑143 (MQ=255) agcttttttaatCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCATCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGTGTGTGttgttgtgttttcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctacctttttttacttcctttacatttaccctgtttttccatagggattaatttagcaccgcctaat > 2:390446‑M1/4‑138 (MQ=255) tAATCTGAGCCCTTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccattgtgattaatgtagcaccgcctaattgcggtgc > 2:317267‑M1/1‑130 (MQ=255) tAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatggagcaccgcctaattgcggtg < 1:593155‑M1/250‑121 (MQ=255) gAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatgtagcaccgcctaattgcggtgctttttt > 1:224562‑M1/1‑124 (MQ=255) aGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGCACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatgtagaaccgcctaattgcggtgcttttttt > 1:652155‑M1/1‑123 (MQ=255) aGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatgtagcaccgcctaattgcggtgcttttttt > 2:174418‑M1/1‑123 (MQ=255) ccATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatgtagcaccgcctaattgcggtgctttttttta < 1:317267‑M1/251‑131 (MQ=255) cATTATCAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAACTACCTATAGTGGAGGCACTTCCTGCGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccctggtagcaaagctaccttttttcacttcctttacatttaccctgtctgtccatagtgattcatgtagcaccgcctaattgcggtgcttttttttac > 2:300871‑M1/1‑120 (MQ=255) aTTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttacccggtctgtccatagtgattaatgtagcaccgcctaattgcggtgctttttttgaccttgcgat < 2:488027‑M1/251‑140 (MQ=255) cTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatgtagcaccgcctaattgcggtgcttttttttaccttgcgatcgcgaattactgatcc > 1:505468‑M1/1‑96 (MQ=255) aCCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatgtagcaccgcctaattgcggtgcttttttttaccttgcgatcgcgaattactgatcc < 1:43274‑M1/249‑156 (MQ=255) aCCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACGTCCTGAGCCGGAACGATAGGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTTAACTTTTGGCTTACGGGTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagcttccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctttccatagtgattaatgtagcatcgcctaattgcggtgcttttttttaccttgcgatcgcgaattactgatcca < 1:362594‑M1/250‑157 (MQ=255) aGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatgtagcaccgcctaattgcggtgcttttttttaccttgcgatcgcgaattactgatccagttc < 2:407948‑M1/251‑161 (MQ=255) aCCTATAGTGGCGGCCCTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacattttccctgtctgtccatagtgattaatgtagcaccgcctaattgcggtgcttttttttaccttgcgatcgcgaattactgatccagttcgaccatc < 2:504938‑M1/251‑168 (MQ=255) aCCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatgtagcaccgcctaattgcggtgcttttttttaccttgcgatcgcgaattactgatccagttcgaccatc < 1:112967‑M1/251‑168 (MQ=255) gAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatgtagcaccgcctaattgcggtgcttttttttaccttgcgatcgcgaattactgatccagttcgaccatctctttcacgtcagtacggtt < 2:334774‑M1/249‑188 (MQ=255) gAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccagggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatgtagcaccgcctaattgcggtgcttttttttaccttgcgatcgcgaattactgatccagttcgaccatctcgttcacgtcagtacggttgatctgctgttt < 1:519757‑M1/251‑200 (MQ=255) gTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttgtcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatgtagcaccgcctaattgcggtgcttttttttaccttgcgatcgcgaattactgatccagttcgaccatctctttcacgtcagtacggttgatctgctgtttgttgc < 1:688879‑M1/251‑205 (MQ=255) gTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatgtagcaccgcctaattgcggtgcttttttttaccttgcgatcgcgacttactgatccagttcgaccatctctttcacgtcagtacggttgatctgctgtttgttgccattagcgtctttatacgaaatc > 2:354368‑M1/1‑24 (MQ=255) tttGGCTTACGGTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagtccatggtagcaaagctaccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatgtagcaccgcctaatttcggtgcttttttttaccttgcgatcgcgaattactgatccagttcgaccatctctttcacgtcagtacggttgatctgctgtttgttgccattagcgtctttatacgaaatcataccg < 1:456313‑M1/250‑234 (MQ=255) ggTTGTGttgttgtgtttgcaattggtctgcgattcagaccatggtagcaaagcttccttttttcacttcctgtacatttaccctgtctgtccatagtgattaatgtagcaccgcctaattgcggtgcttttttttaccttgcgatcgcgaattactgatccagttcgaccatctctttcacgtcagtacggttgatctgctgtttgttgccattagcgtctttatacgaaatcataccggtatcgttatc < 1:13609‑M1/251‑245 (MQ=255) | GGCATCAAAAACTCGTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTA > NC_000913/2942520‑2943008 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |