| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,942,775 | (GTTGTGTT)2→1 | noncoding (80‑87/206 nt) | gcvB → | small regulatory RNA GcvB |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2942775 | 2942782 | 8 | 30 [1] | [0] 29 | gcvB | small regulatory RNA GcvB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2942774 | 1 (0.030) | 29 (0.880) | 27/468 | 0.3 | 98.4% | noncoding (79/206 nt) | gcvB | small regulatory RNA GcvB |
| ? | NC_000913 | 2942783 = | 0 (0.000) | noncoding (88/206 nt) | gcvB | small regulatory RNA GcvB | |||||
GTAAGGCATTTAGCGGTGGTAATCGTTTAGACATGGCTATTAAACTTTGATGTTAAATGAATTTAACAATTAGATCACACTATGTAACCTATTAGTTTTTTTAATCTGAGCCATTATAAATTGTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTG > NC_000913/2942534‑2943022 | aaaaactcgtaaggcatttagcggtggtaatcgtttagacatggctattaaactttgatgttaaatgaatttaacaattatatcacactatgtaacctattaggttttttaatctgagccattataaattgtccgttgagcttctaccagcaaatacctatagttgcggcacttcctgagccgtaacgaaaaggtttatcggaatgctggttggggtgaactttgggctgactgttgtgattttatgttTg < 2:149342‑M2/2‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |