| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,290,881 | IS1 (+) +9 bp | coding (640‑648/1014 nt) | rssB → | regulator of RpoS |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 15 (1.290) | 12/304 | 0.1 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1290881 = | 0 (0.000) | coding (640/1014 nt) | rssB | regulator of RpoS | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1290889 | 0 (0.000) | 16 (1.370) | 10/304 | 0.1 | 100% | coding (648/1014 nt) | rssB | regulator of RpoS |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
GGGATGCAATGGTTGATAACCCTGCCGCAGCGGCGAAATTATTACAGGAACTACAACCGCCGGTTCAGCAGGTGATTTCCCATTGCCGGGTTAATTATCGTCAATTGGTTGCCGCGGACAAACCCGGCCTGGTGCTTGATATTGCCGCACTTTCGGAAAACGATCTGGCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1290669‑1290889‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGC < NC_000913/1979270‑1979027 GGGATGCAATGGTTGATAACCCTGCCGCAGCGGCGAAATTATTACAGGAACTACAACCGCCGGTTCAGCAGGTGATTTCCCATTGCCGGGTTAATTATCGTCAATTGGTTGCCGCGGACAAACCCGGCCTGGTGCGTGATATTGCCGCACTTTCGGAAAACGATCTGGCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 1:212400/1‑251GGGATGCAATGGATGATAACCCTGCCGCAGCGGCGAAATTATTACAGGAACTACAACCGCCGGTTCAGCAGGTGATTTCCCATTGCCGGGTTAATTATCGTCAATTGGTTGCCGCGGACAAACCCGGCCTGGTGCTTGATATTGCCGCACTTTCGGAAAACGATCTGGCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 1:212407/1‑251 nCCTGCCGCAGCGGCGAAATTATTACAGGAACTACAACCGCCGGTTCAGCAGGTGATTTCCCATTGCCGGGTTAATTATCGTCAATTGGTTGCCGCGGACCAACCCGGCCTGGTGCTTGATATTGCCGCACTTTCGGAAAACGATCTGGCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG > 1:32403/2‑241 ACAGGAACTACAACCGCCGGTTCAGCAGGTGATTTCCCATTGCCGGGTTAATTATCGTCAATTGGTTGCCGCGGACAAACCCGGCCTGGTGCTTGATATTGCCGCACTTTCGGAAAACGATCTGGCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 1:136153/1‑238 aaaacaaaAACCGCCGGTTCAGCAGGTGATTTCCCATTGCCGGGTTAATTAGCGTCAATTGGTTGCCGCGGACAAACCCGGCCTGGTGCTTGATATTGCCGCACTTTCGGAAAACGATCTGGCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGn < 1:52001/243‑2 nCGGACAAACCCGGCCTGGTGCTTGATATTGCCGCACTTTCGGAAAACGATCTGGCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCT > 1:71700/2‑202 ACAAACCCGGCCTGGTGCTTGATATTGCCGCACTTTCGGAAAACGATCTGGCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCT > 1:94838/1‑251 AACCCGGCCTGGTGCTTGATATTGCCGCACTTTCGGAAAACGATCTGGCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC < 1:6684/183‑1 CCGGCCTGGTGCTTGATATTGCCGCACTTTCGGAAAACGATCTGGCATTGGATGGCCTTGAGGGCACCCGAGCTGGACAGAATGGCGTACGTGCTGCCGGTGATGCGTCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG < 1:133658/156‑1 nTGGTGCTTGATATTGCCGCACTTTCGGAAAACGATCTGGCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAC > 1:31207/2‑219 nCGCACTTTCGGAAAACGATCTGGCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAAC > 1:55037/2‑192 GAAAACGATCTGGCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGAGTTAGTTTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGTCGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCCCGGCTCTCACTGCCGTAAGACATGGC < 1:98409/239‑1 CCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC < 1:40348/128‑1 TGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTTCTGCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTTTTTGGGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTTTCCCGCCTGTTCAGCTACTTACGGGTTGGTGCGTAACGGGAAAGGCCCCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGG < 1:127748/209‑1 TACTTGCTGCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 1:241106/1‑54 GCTGCCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGC < 1:9112/250‑1 GGGATGCAATGGTTGATAACCCTGCCGCAGCGGCGAAATTATTACAGGAACTACAACCGCCGGTTCAGCAGGTGATTTCCCATTGCCGGGTTAATTATCGTCAATTGGTTGCCGCGGACAAACCCGGCCTGGTGCTTGATATTGCCGCACTTTCGGAAAACGATCTGGCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1290669‑1290889‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGC < NC_000913/1979270‑1979027 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |