| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,431,062 | IS2 (–) +5 bp | coding (2014‑2018/3363 nt) | stfR → | putative prophage side tail fiber protein StfR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 1431062 = | 0 (0.000) | 98 (0.860) | 64/588 | 0.3 | 100% | coding (2014/3363 nt) | stfR | putative prophage side tail fiber protein StfR |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1431066 | 0 (0.000) | 91 (0.800) | 60/588 | 0.4 | 100% | coding (2018/3363 nt) | stfR | putative prophage side tail fiber protein StfR |
| ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
CCGCAGGCGATCCGATGAATAACTGCGAGTTTAACGGATTTGTTATGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGTGCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAGGTGATGTTTATGGTGGCTGGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTAT > NC_000913/1430775‑1431360 | tctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccangttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCGGCGACTGAATGt > 1:675498‑M1/286‑300 (MQ=255) ggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccatagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCGGCGACTGAATGTATcgc > 2:43301‑M1/281‑300 (MQ=255) ggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCGGCGACTGAATGTATcg > 1:488800‑M1/281‑299 (MQ=255) ggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggcggctacaccatgttgccgggcaacgaggtagaccgtcatccccggtgcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCGGCGACTGAATGTATcg > 1:484579‑M1/281‑299 (MQ=255) 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tAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttc < 2:548232‑M1/300‑262 (MQ=255) acgatACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcgg < 2:62304‑M1/298‑264 (MQ=255) ggagattcagggggccagtctaCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGTGCAAAAAACTTTTTGCAACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAGGTGATGTTTATGGTGGCTGGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATaa < 1:386901‑M1/278‑1 (MQ=255) 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CCGCAGGCGATCCGATGAATAACTGCGAGTTTAACGGATTTGTTATGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGTGCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAGGTGATGTTTATGGTGGCTGGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTAT > NC_000913/1430775‑1431360 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |