| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,431,062 | IS2 (–) +5 bp | coding (2014‑2018/3363 nt) | stfR → | putative prophage side tail fiber protein StfR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1431062 = | 0 (0.000) | 98 (0.860) | 64/588 | 0.3 | 100% | coding (2014/3363 nt) | stfR | putative prophage side tail fiber protein StfR |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1431066 | 0 (0.000) | 91 (0.800) | 60/588 | 0.4 | 100% | coding (2018/3363 nt) | stfR | putative prophage side tail fiber protein StfR |
| ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region | |||||
CCGCAGGCGATCCGATGAATAACTGCGAGTTTAACGGATTTGTTATGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1430775‑1431066‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCGAACTG < NC_000913/1651548‑1651259 CCGCAGGCGATCCGATGAATAACTGCGAGTTTAACGGATTTGTTATGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTT > 2:908109/1‑299 GATGAATAACTGCGAGTTTAACGGATTTGTTATGCCTGGTGGCTGGACTGACATGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATAAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGNGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGACCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACATATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCC < 2:293489/300‑1 ATGAATAACTGCGAGTTTAACGGATTTGTTATGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCA > 1:55025/1‑300 ATGAATAACTGCGAGTTTAACGGATTTGTTATGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCATGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCA > 1:55920/1‑300 AGTTTAACGGATTTGTTATGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATTGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGTGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATC < 1:352125/300‑1 AGTTTAACGGATTTGTTATGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATC < 1:351792/300‑1 TTAACGGATTTGTTATGCCGGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT < 1:713034/300‑1 CGGATTTGTTATGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC > 1:393899/1‑300 GGATTTGTTATGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTGCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGTTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATTGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTTGTGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATGTTCAGACATCTGTTATCACT < 2:405074/295‑1 tttgttggtctTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATTGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT < 2:314821/281‑1 GTTATGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGTGCTCTGGGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGCAGATGACATGTCAATATCCGCACCTGGTACTGGTCTCGTTGTTAATGATACGAACTATAAGTTTGGGGAAACAAATCAGGCTGGATTTGCACCTATATTTCCAGATATCTGTTATCGCTTAACCCATT > 2:275895/1‑298 GTTATGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTAC > 2:275959/1‑300 ATGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCAGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAAACATTACAA > 2:180130/1‑299 GCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCC < 2:833288/300‑1 GACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGA > 2:901358/1‑300 GACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATT > 1:62304/1‑300 GACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCAGCAGATATT > 2:463046/1‑300 GGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGG < 1:709223/300‑1 GCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGTTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAACCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC > 2:867167/1‑300 GCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC > 2:555432/1‑300 GCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC > 1:343578/1‑300 GCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTNATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC > 2:658532/1‑300 GTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGA > 1:739116/1‑300 GCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAATGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCCTGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAACCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGAT > 1:464573/1‑300 CTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACTCAATAGTGATGAGTAATAAGGGCGATGATTTGCGCTCTGTGTTCTATGTTGATGGCGCTGCTTTCCCTGTTTTTGCGTTTATTGAAGATGGCATGTCAATATCCGCACCTGGTGCTGATCTCGTTGTTAATGATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGTGATA > 2:15794/1‑300 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |