| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,931,171 | IS4 (–) +12 bp | intergenic (‑78/‑134) | ravA ← / → kup | regulatory ATPase RavA/K(+):H(+) symporter Kup |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3931171 = | 0 (0.000) | 19 (1.080) | 15/292 | 0.1 | 100% | intergenic (‑78/‑145) | ravA/kup | regulatory ATPase RavA/K(+):H(+) symporter Kup |
| ? | NC_000913 | = 4503515 | NA (NA) | noncoding (1/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3931182 | 0 (0.000) | 24 (1.380) | 17/290 | 0.1 | 100% | intergenic (‑89/‑134) | ravA/kup | regulatory ATPase RavA/K(+):H(+) symporter Kup |
| ? | NC_000913 | 4502090 = | NA (NA) | noncoding (1426/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
GACCATCATTTCGAGGGGAAGACGGCGCTTGCGTAGCGTTACAGTACCTGATTCGGCAAGGCAACGAGAGATGAGTTCGGGGTCGAGGTAATCCCCCAGAGAAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCAGTCTTTCCTCATTTGACGAAGGGAGTTTTATTCAACCTGAACGGACTACG > NC_000913/4503267‑4503761 | gACCATCATTAGGAGGGGAAGACGGCGCTTGCGTAGCGTTACAGTACCTGATTCGGCAAGGCAACGAGAGATGAGTTCGGGGTCGAGGTAATCCCCCAGAGAAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAAt > 1:125278/1‑251 (MQ=255) cgcTTGCGAAGCGTTACAGTACCTGATTCGGCAAGGCAACGAGAGATGAGTGCGGGTTCGAGGTAAGCCCCCAGAGAAGTCAGTGTGTTACGTAGAGAAACGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCGTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAGACAAGTGAGCATTTCCGGAGTCTTGCACAGCCACTATATCGGGCAACTGAGCCTTAGCTTATCGGCATTActcaaagggggggtatttttctttgag > 1:219718‑M2/1‑224 (MQ=255) tACCTGATTCGGCAAGGCAACGAGAGATGAGTTCGGGGTCGAGGTAATCCCCCAGAGAAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCTGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTActcaaaggggg > 1:58204‑M2/1‑205 (MQ=255) aCCTGATTCGGCAAGGCAACGAGAGATGAGTTCGGGGTCGAGGTAATCCCCCAGAGAAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATgn < 1:270172/251‑2 (MQ=255) 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ncATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTAACCTGATCCTTAACTGATCGGCCTTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAAc > 1:50159/2‑115 (MQ=255) cATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACGGATCGGCATTActcaaagggggggtatttttctttgagccaggttaatgtggccgcatttaggattacgattttgccgttaatcgtgc > 1:140286‑M2/1‑87 (MQ=255) cGGAAACAACTGAGCGTTTCCGGATTCTTACCCAGCCAATGGATCGGTCAACTGATCCTTACCTGATCGGCATTAATATTGGTTCTGGTGTTTGTAACACACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTCTAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAAAACTGCACAGGAAAACAGCTATAACGTa > 1:180661/1‑250 (MQ=255) gTGAGCGTTTCCGGATTCTTACAAAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTActcaaagggggggtatttttctttgagccaggttaatgtggccgcatttaggagtacgattttgccgntaannnnncann < 2:281575‑M2/146‑81 (MQ=255) gCGTTTCCNGNNNCNNACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATNAATCTTGGTTCTGGTNTTNGTAANAAANTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAAc > 2:306216/1‑130 (MQ=255) gCGTTTCCNGNNNCNNACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATNAATCTTGGTTCTGGTNTTNGTAANAAANTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAAc > 2:306193/1‑130 (MQ=255) gCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAAc < 1:306216/130‑1 (MQ=255) gCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCGTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAAc < 1:306193/130‑1 (MQ=255) ttCCGGACTCTGACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTGAACTGAGCTGCATTAttcaaagggggggtatttttctttgagccaggttaatgtggccgcatttagg > 1:68009‑M2/1‑58 (MQ=255) acacAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTActcaaagggggggtatttttctttgagccaggttaatgtggccgcatttaggagtacgattttgccgttaatcgtgcatactgtgcgcttttttgtgggccaagggactaagcacacatttcatatttcaacgaaagactagtctatgagcactgataataagcaatcattgcccgcgattaccctcgcggcgattggagttgtn > 1:281575‑M2/1‑46 (MQ=255) 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tGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTCTCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAACACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACctc > 1:257434/1‑216 (MQ=255) gATCCTTAACTGATCGGCCTTActcaaagggggggtatttttctttgagccaggttaatgtggccgcatttaggagaacgatttt < 1:376316‑M2/85‑64 (MQ=255) gATCCTTAACTGATCGGCATTActcaaagggggggtatattgctttgagccaggttaatgtggccgcatttaggagtacgattttgccgttaatcgtgn > 1:46371‑M2/1‑22 (MQ=255) gATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGTAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCAGTCTTTCCTCATTTGACGAAGGGAGTTTTATTCAACCTGAAc < 1:140576/249‑1 (MQ=255) 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GACCATCATTTCGAGGGGAAGACGGCGCTTGCGTAGCGTTACAGTACCTGATTCGGCAAGGCAACGAGAGATGAGTTCGGGGTCGAGGTAATCCCCCAGAGAAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCAGTCTTTCCTCATTTGACGAAGGGAGTTTTATTCAACCTGAACGGACTACG > NC_000913/4503267‑4503761 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |