| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 62,379 | Δ25,896 bp | [rapA]–[cra] | 25 genes [rapA], polB, araD, araA, araB, araC, yabI, thiQ, thiP, thiB, sroA, sgrR, sgrS, sgrT, setA, leuD, leuC, leuB, leuA, leuL, leuO, yabR, ilvI, ilvH, [cra] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 62379 | 88274 | 25896 | 84 [0] | [0] 84 | [rapA]–[cra] | [rapA],polB,araD,araA,araB,araC,yabI,thiQ,thiP,thiB,sroA,sgrR,sgrS,sgrT,setA,leuD,leuC,leuB,leuA,leuL,leuO,yabR,ilvI,ilvH,[cra] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 62378 | 0 (0.000) | 84 (0.750) | 58/588 | 0.5 | 100% | coding (887/2907 nt) | rapA | RNA polymerase‑binding ATPase and RNAP recycling factor |
| ? | NC_000913 | 88275 = | 0 (0.000) | coding (248/1005 nt) | cra | DNA‑binding transcriptional dual regulator Cra | |||||
CTGCAACAGCGGCTCGATATCCTGCTCGCCGATCATCTCGCCGAGCATGTTCAGTTCGTCATTGCTCAGTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/62104‑62378‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTC > NC_000913/88275‑88559 CTGCAACAGCGGCTCGATATCCTGCTCGCCGATCATCTCGCCGAGCATGTTCAGTTCGTCATTGCTCAGTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAAC > 1:361542/1‑296 GCGGCTCGATATCCTGCTCGCCGATCATCTCGCCGAGCATGTTCAGTTCGTCATTGCTCAGTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAAC < 2:574554/300‑1 GCTCGATATCCTGCTCGCCGATCATCTCGCCGAGCATGTTCAGTTCGTCATTGCTCAGTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGC > 1:346836/1‑300 CGATATCCTGCTCGCCGATCATCTCGCCGAGCATGTTCAGTTCGTCATTGCTCAGTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCCACGCACTGCGCACAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCACGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCACAGGGGTTATCAACTGCTGA > 2:344240/1‑300 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TCTCGCCGAGCATGTTCAGTTCGTCATTGCTCAGTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGC > 1:666220/1‑300 TCGCCGAGCATGTTCAGTTCGTCATTGCTCAGTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCACAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCA > 2:810627/1‑300 AGCATGTTCAGTTCGTCGTTGCTCAGTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCACAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCATGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCAAGACAAC > 1:106091/1‑300 AGCATGTTCAGTTCGTCATTGCTCAGTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAAC > 1:105901/1‑300 ATGTTCAGTTCGTCATTGCTCAGTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGA < 1:786831/299‑1 TGTTCAGTTCGTCATTGCTCAGTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATNGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACNGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAA > 2:661159/1‑300 CAGTTCGTCATTGCTCAGTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGC > 1:662876/1‑299 ATTGCTCAGTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTG < 1:824032/299‑1 TGCTCAGTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGC < 1:652839/300‑1 GTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCCGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTT > 2:371773/1‑300 GTTTGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTT > 1:35826/1‑300 TGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGTTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTAC < 2:476517/300‑1 TGTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTAC < 1:482222/300‑1 GTTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCTTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACA > 1:526960/1‑300 TTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGTGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAG < 2:574741/300‑1 TTACCTGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAG < 2:524128/300‑1 TGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGNCGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCNGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCA > 2:664945/1‑300 TGCCAGCAGCATGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCA > 2:802464/1‑300 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TGGCAACGGCGTCCGCAACCGGACGATAATTTTTCTGCTCTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAAAGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCA > 2:600736/1‑300 GGCGTCCGCAACCGGACGGTAATTTTTCTGCTCTTCAACAAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTG < 2:160227/299‑1 CTTCAACGAACTGCGCAAAATCGTGGAAACGGTTCGGGTCCAGCAGACGCAGACGGGCGAAGTGGCTTTCCATCCCCAGCTGTTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGTATCCTTTTT > 2:120924/1‑300 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TTCCGGGGTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTT > 1:468262/1‑298 GTCGCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGAT > 1:793003/1‑300 GCGGTCAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAAACAAAGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTAAAGCGTCAGGTTGCTGCCATTATTGTTTCGCCGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCACTCGATCGTGAACACTTCACCCGCGTGGTTGGTGCCGCTCA > 2:549930/1‑299 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CAGCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGA > 1:97148/1‑300 GCAGCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGAT > 1:799414/1‑299 GCAGAACGCCCGGCACGTGCTCTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCC > 2:768996/1‑299 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CTGCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTAC > 1:544478/1‑300 GCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGT < 2:751111/300‑1 GCCAGTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTAACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGT < 1:61994/300‑1 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GTTGTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCAACAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGT > 1:83373/1‑300 GTTCAATGGCCTGATTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTC > 1:95495/1‑300 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NC_000913/62104‑62378‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATCAACTGCTGATTGCCTGCTCAGAAGATCAGCCAGACAACGAAATGCGGTGCATTGAGCACCTTTTACAGCGTCAGGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTC > NC_000913/88275‑88559 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |