| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_012971 | 4487867 = | 0 (0.000) | intergenic (‑64/+69) | ECD_RS22235/ECD_RS22240 | IS1‑like element IS1A family transposase/restriction endonuclease subunit S | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
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TTATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCA‑ACTTTTTTTGTTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGATTTGTGGGATTTGCTCNAGGCGTGCTTTGGTGCTGTCTACCTGCGCCAGCAGCGTATCGAGTTTTTCAGCGATGATTTTTTGCTCGGCAAGTGGTGGCAACGGAAGTAGGGTATCTTGAAGTGTCCTGGAAGAAAGATGCTTTACAGTAACC < 2:594933/300‑1 TATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCA‑ACTTTTTTTGTTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGATTTGTGGGATTTGCTCAAGGCGTGCTTTGGTGCTGTCTACCTGCGCCAGCAGCGTATCGAGTTTTTCAGCGATGATTTTTTGCTCGGCAAGTGGTGGCAACGGAAGTAGGGTATCTTGAAGTGTCCTGGAAGAAAGATGCTTTACAGTAACCG < 1:293017/300‑1 TATTCAAAATTGTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGACTTTGTAGTTATCTAATTCA‑ACTTTTTTTGTTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGATTTGTGGGATTTGCTCAAGGCGTGCTTTGGTGCTGTCTACCTGCGCCAGCAGCGTATCGAGTTTTTCAGCGATGATTTTTTGCTCGGCAAGTGGTGGCAACGGAAGTAGGGTATCTTGAAGTGTCCTGGAAGAAAGATGCTTTACAGTAACCG < 1:292672/300‑1 ATTCAGGAGATATTCTGGCAACGGCACGAGCGATATTAACATTTATATCTTCTCTAACAATACCTATTCTACCTATAGCCCCAACAATTGTTACAAGAATGTCATTCTTTCGTACTTTGGAACGCTTATATTGTAAATCTATTTCCTTTGAAATTTTACGAAGATGATTTAAATCTACTTCACCATCGTTAATATCACAAACACGAATTAATTCTATACCGTCTTTTATATCATCTCCAGGTTGCACCACACCATAACATAATGGTCTTTGTGTATTGATAATGTTATTCAAAATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012971/4486794‑4487090‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caaaattgTTTCACTCCAGTCTTCTGGAATAAGGATTTTGTAGTTATCTAATTCA‑ACTTTTTTTGTTATAAAATCTTTATCTTCTTTGGTCAACCTACCAGTTACTGCCGCAGCCAACACCGCCTGACGAAAACGTTTCAGGATTTGTGGGATTTGCTCAAGGCGTGCTTTGGTGCTGTCTACCTGCGCCAGCAGCGTATCGAGTTTTTCAGCGATGATTTTTTGCTCGGCAAGTGGTGGCAACGGAAGTAGGGTATCTTGAAGTGTCCTGGAAGAAAGATGCTTTACAGTAACCG > NC_012971/4487867‑4488154 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |