| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012971 | = 132475 | 122 (1.170) | 9 (0.090) | 9/566 | 6.7 | 7.5% | coding (1591/1854 nt) | yacH | DUF3300 domain‑containing protein |
| ? | NC_012971 | 132572 = | 103 (1.020) | coding (1494/1854 nt) | yacH | DUF3300 domain‑containing protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCTCACGCGCTGCCTCTCTTCGCTGCTGGATCTTCGGGTTAGTCTGCATTCTCTCGCGAACTGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGATAACGCTGACGAGCGGCGTCCTTTTGTTGCTGGGTCAGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGA > NC_012971/132274‑132854 | cGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATgc > 1:669661/1‑300 (MQ=255)cGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACAACTGGCGCTGCTATGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTAGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCATGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATgc > 2:57475/1‑300 (MQ=255)cGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTACCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATgc > 2:57852/1‑300 (MQ=255) ttATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTAGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATgcgc > 2:419688/1‑300 (MQ=255) tATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCTAAAAACCTGACGTTGTTCAGTTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCt < 2:100978/300‑1 (MQ=255) tATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCt < 1:148639/300‑1 (MQ=255) tGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCTGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCTCACgcgc < 1:775965/298‑1 (MQ=255) aCAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGATGCGGACTGAATGCGCTCACGCGCTGcc > 1:272810/1‑300 (MQ=255) aGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGTGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCTAAAAACCTTACTTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGGACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCTCACGCGCTGCctc < 2:299535/300‑1 (MQ=255) ggTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTTCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCTCACGCGCTGCCTCTCTTc > 1:227295/1‑300 (MQ=255) 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gCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCTCACGCGCTGCCTCTCTTCGCTGCTGGATCTTCGGGTTAGTCTGCATTCTCTCGCGAACTGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGATAACGCTGACGAGCGGCGTCCTTTTGTTGCTGGGTCAGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGa > 1:514844/1‑300 (MQ=255) gCCTAGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCTCACGCGTTGCCTCTCTTAGCTGCTGGATCTTAGGGTTAGTCTGTATTCTCTAGCGAACTGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGATAATGCTGACGAGCGGCGTTCTTTTGTTGCTGGGTAAGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTCTCTCGTGTAATGAATGGTGCGGCGTGTGTCCGTTGCTGAAACTGa > 2:289316/1‑300 (MQ=255) tGGCGCTGATCAGGCGAGGCGTACTGAATGCGCTCACGCGNTGCCTCTCTTCGCTGCTGGATCTGCGGGTTAGTCTGCATTCTCTCGCGAACTGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGTACTGATAACGCTGACGAGCGGCGTCCTTTTGTCGCTGGGTCAGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAg < 2:278990/207‑1 (MQ=255) 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CGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCTCACGCGCTGCCTCTCTTCGCTGCTGGATCTTCGGGTTAGTCTGCATTCTCTCGCGAACTGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGATAACGCTGACGAGCGGCGTCCTTTTGTTGCTGGGTCAGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCTGTGCCGCTGCCTGACGTTGGGTATCTCGTGTAATGACTGGTGCGGCGTGTGTTCGTTGCTGAAACTGATTTGCTGCCGCCTGA > NC_012971/132274‑132854 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |