| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012971 | = 132475 | 122 (1.170) | 9 (0.090) | 9/566 | 6.7 | 7.5% | coding (1591/1854 nt) | yacH | DUF3300 domain‑containing protein |
| ? | NC_012971 | 132572 = | 103 (1.020) | coding (1494/1854 nt) | yacH | DUF3300 domain‑containing protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
AGCGGCTAACCACGCCGCTTTTTTTACGTCTGCAATTTACCTTTCCAGTCTTCTTGCTCCACGTTCAGAGAGACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCTCACGCGCTGCCTCTCTTCGCTGCTGGATCTTCGGGTTAGTCTGCATTCTCTCGCGAACTGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGATAACGCTGACGAGCGGCGTCCTTTTGTTGCTGGGTCAGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCT > NC_012971/132176‑132771 | aGCGGCTAACCACGCCGCTTTTTTTACGTCTGCAATTTACCTTTCCAGTCTTCTTGCTCCACGTTCAGAGAGACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAAt < 2:744198/300‑1 (MQ=255) gCTAACCACGCCGCTTTTTTTACGTCTGCAATTTACCTTTCCAGTCTTCTTGCTCCACGTTCAGAGAGACGTTCGCGTCCTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTACCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATAcac > 2:15678/1‑298 (MQ=255) tAACCACGCCGCTTTTTTTACGTCTGCAATTTACCTTTCCAGTCTTCTTGCTCCACGTTCAGATAGACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCt < 2:585424/299‑1 (MQ=255) tAACCACGCCGCTTTTTTTACGTCTGCAATTTACCTTTCCAGTCTTCTTGCTCCACGTTCAGAGAGACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTTACATTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCt < 2:793946/299‑1 (MQ=255) tAACCACGCCGCTTTTTTTACGTCTGCAATTTACCTTTCCAGTCTTCTTGCTCCACGTTCAGAGAGACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCt < 1:802371/299‑1 (MQ=255) aCGCCGCTTTTTTTACGTCTGCAATTTACCTTTCCAGTCTTCTTGCTCCACGTTCAGATAGACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCAcgc < 1:740035/299‑1 (MQ=255) tttttACGTCTGCAATTTACCTTGCCAGTCTTCTTGCTCCACGTTCATAGAGACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGTTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGtctc < 2:218483/300‑1 (MQ=255) ttttACGTCTGCAATTTACCTTTCCAGTCTTCTTGCTCCACGTTCAGAGAGACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATGCGCTCACGCGCTGCctctct > 1:682350/1‑300 (MQ=255) ttCCAGTCTTCTTGCTCCACGTTCAGAGAGACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGtt > 1:37929/1‑300 (MQ=255) aGTCTTCTTGCTCCACGTTCAGATATACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGNCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTc < 2:616733/300‑1 (MQ=255) aGTCTTCTTGCTCCACATTCAGATAGACATTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCTAAAAACCTGACGTTGTTTAGTTGATGCCGATTGAACACGCTGNCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTTCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTc < 2:616179/300‑1 (MQ=255) ttcttGCTCCACGTTCAGAGAGACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCa > 1:630484/1‑300 (MQ=255) tcttGCTCCACGTTCAGATAGACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCAt < 1:565730/300‑1 (MQ=255) tcttGCTCCACGTTCAGAGAGACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCAt < 1:566241/300‑1 (MQ=255) gTTCAGAGAGACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGaa > 1:815603/1‑300 (MQ=255) gTTCAGAGAGACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTACCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCATTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGaa > 1:815669/1‑300 (MQ=255) agagagACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGc > 1:720386/1‑300 (MQ=255) gaCGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTTACGTTGTTCAGTTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGgc < 1:448094/300‑1 (MQ=255) gTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGgcgc < 1:832650/299‑1 (MQ=255) ttCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGTACTNAATGCGCTCACGCGCTGCCTCTCTTCGCTGCTGGATCTTCGGGTTAGTCTGCATTCTCTAGCGAACTGCCTGGCgct > 1:165843/1‑299 (MQ=38) gcttactacTGGCCGTTGTTCGTTAGTCAGCTTGACGGTAGGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGGGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGTTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTc < 2:62005/297‑1 (MQ=255) gcgTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGTTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTc < 1:145531/300‑1 (MQ=255) gcgTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTc > 2:827562/1‑300 (MQ=255) gcgTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGCGTTAGTCTGCATTCTCTCGCGAACTGCCTGGCGCTGCTc < 2:451587/300‑1 (MQ=255) ctgctgACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTTATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCaggc > 1:55880/1‑299 (MQ=255) 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gAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCTCACGCGCTGCCTCTCTTCGCTGCTGGATCTNCGGGTTAGTCTGCATTCTCTCGCGAACTGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGATAACGCTGACGAGCGGCGTCCTTTTGTTGCTGGGTCAGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCt > 2:602354/1‑300 (MQ=255) gAATACGCTCACGCGCTGCGTCTATTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCTCACGCGCTGCCTCTCTTCGTTGCTGGATCTTCGGGTTAGTCTGCCTTCTCTCGCGAACTGCCTGGCGCTGCTCAGGTGAGGCGGACTGATAACGCTGACGCGCGGCGTCCTTTTGTTGCTGGGTCAGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTAGTAATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTAATTAAACCGCt > 2:386377/1‑300 (MQ=255) gAATACGCTCACGCGCTGCGTCTATTAGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCTCACGCGTTGCCTCTCTTCGCTGCTGGATCTTCGGGTTAGTCTGCATTCTCTAGCGAACTGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGATAACGCTGACGAGCGGCGTCCTTTTGTTGCTGGGTCAGTGGTTGGCGCCGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCt > 2:437692/1‑300 (MQ=255) | AGCGGCTAACCACGCCGCTTTTTTTACGTCTGCAATTTACCTTTCCAGTCTTCTTGCTCCACGTTCAGAGAGACGTTCGCGTACTGCTGACCGTTGCTCGTTATTCAGCCTGACAGTATGGTTACTGTCGTTTAGACGTTGTGGGCGGCTCTCCTGAACTTTCTCCCGAAAAACCTGACGTTGTTCAGGTGATGCCGATTGAACACGCTGGCGGGCGTTATCACGTTGCTGTTGATTCAGTGGGCGCTGCTGTACTTTTTCCTTAAACACCTGGCGCTGCTCTGGTGATGCGGACTGAATACGCTCACGCGCTGCGTCTCTTCGCTGCTGGTTCTGCGGGTTAGTCTGCATTTTCTCGCGAACCGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGAATGCGCTCACGCGCTGCCTCTCTTCGCTGCTGGATCTTCGGGTTAGTCTGCATTCTCTCGCGAACTGCCTGGCGCTGCTCAGGCGAGGCGGACTGATAACGCTGACGAGCGGCGTCCTTTTGTTGCTGGGTCAGTGGTTGGCGACGGCTGAAGTCGTGGAAGTCGTCATAGCTCCCATAGTGTTCAGCTTCATTAAACCGCT > NC_012971/132176‑132771 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |