| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 2,788,791 | IS5 (–) +4 bp | intergenic (‑2954/‑191) | ileY ← / → glaH | tRNA‑Ile/glutarate dioxygenase GlaH |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 121 (1.240) | 77/586 | 0.0 | 99.2% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2788791 = | 1 (0.010) | intergenic (‑2954/‑194) | ileY/glaH | tRNA‑Ile/glutarate dioxygenase GlaH | |||||
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tgttcgcaccttccTTAGTTATTCATTTCCTGTCTCACTTTGCCTTAATACCCTACGTTAAATGTTACTAATTTGTTGCTTTTGATCACAATAAGAAAACAATATGTCGCTTTTGTGCGCATTTTTCAGAAATGTAGATATTTTTAGATTATGGCTACGAAATGAGCATCGCCATGTCACCCTACATCTCATAAGAGGATCGCTTCTGATGAATGCACTGACCGCCGTACAAAATAACGCTGTCGATTCAGGCCAGGACTATAGCGGATTCACCCTCACCCCGTCGGCGCAATCCCcgcg < 1:655700‑M2/286‑1 (MQ=255) tgttcgcaccttccTTAGTTATTCATTTCCTGTCTCACTTTGCCTTAATACCCTACGTTAAATGTTACTAATTTGTTGCTTTTGATCACAATAAGAAAACAATATGTCGCTTTTGTGCGCATTTTTCAGAAATGTAGATATTTTTAGATTATGGCTACGAAATGAGCATCGCCATGTCACCCTACATCTAATAAGAGGATCGCTTCTGATGAATGCACTGACCGCAGTACAAAATAACGCTGTCGATTCAGGCCAGGACTATAGCGGATTCACCCTCACCCCGTCGGCGCAATCCCcgc > 2:26309‑M2/15‑299 (MQ=255) aCCTGTTGCTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttagtgagatctctcccactgacgtatcatttggtccgcccgaaacaggttggccagcgtgaataacatcgccagttggttatcgtttttcagcaaccccttgtatctggctttcacgaagccgaactgtcgcttgatga > 2:398899‑M2/1‑14 (MQ=255) 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AGCGTTAACATTATTATTAATAATACCCGAAAAATTATCCCCCCTGGTAAAGTATTTACGCTTAGAGGCGGAACTCTAAATATCAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAAAACGGGGCAGATAATATGTTTAGTTTACTAACGGTCATTTTGCAGTGAAGCCATTTACTGTTTTTTATCGACCAGATAATCTGTTCTCTAATGTTAACTCCCCCTAACCTGTTGCTTTAGTTATTCATTTCCTGTCTCACTTTGCCTTAATACCCTACGTTAAATGTTACTAATTTGTTGCTTTTGATCACAATAAGAAAACAATATGTCGCTTTTGTGCGCATTTTTCAGAAATGTAGATATTTTTAGATTATGGCTACGAAATGAGCATCGCCATGTCACCCTACATCTCATAAGAGGATCGCTTCTGATGAATGCACTGACCGCCGTACAAAATAACGCTGTCGATTCAGGCCAGGACTATAGCGGATTCACCCTCACCCCGTCGGCGCAATCCCCGCGTCTGCTGGAACTCACCT > NC_000913/2788497‑2789093 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |