| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,788,791 | IS5 (–) +4 bp | intergenic (‑2954/‑191) | ileY ← / → glaH | tRNA‑Ile/glutarate dioxygenase GlaH |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 110 (1.130) | 73/586 | 0.1 | 99.1% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2788794 | 1 (0.010) | intergenic (‑2957/‑191) | ileY/glaH | tRNA‑Ile/glutarate dioxygenase GlaH | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 121 (1.240) | 77/586 | 0.0 | 99.2% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2788791 = | 1 (0.010) | intergenic (‑2954/‑194) | ileY/glaH | tRNA‑Ile/glutarate dioxygenase GlaH | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289826‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGTTATTCATTTCCTGTCTCACTTTGCCTTAATACCCTACGTTAAATGTTACTAATTTGTTGCTTTTGATCACAATAAGAAAACAATATGTCGCTTTTGTGCGCATTTTTCAGAAATGTAGATATTTTTAGATTATGGCTACGAAATGAGCATCGCCATGTCACCCTACATCTCATAAGAGGATCGCTTCTGATGAATGCACTGACCGCCGTACAAAATAACGCTGTCGATTCAGGCCAGGACTATAGCGGATTCACCCTCACCCCGTCGGCGCAATCCCCGCGTCTGCTGGAA > NC_000913/2788791‑2789086 CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTATTCAT > 1:137866/1‑300 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TGTTCGCACCTTCCTTAGTTATTCATTTCCTGTCTCACTTTGCCTTAATACCCTACGTTAAATGTTACTAATTTGTTGCTTTTGATCACAATAAGAAAACAATATGTCGCTTTTGTGCGCATTTTTCAGAAATGTAGATATTTTTAGATTATGGCTACGAAATGAGCATCGCCATGTCACCCTACATCTCATAAGAGGATCGCTTCTGATGAATGCACTGACCGCCGTACAAAATAACGCTGTCGATTCAGGCCAGGACTATAGCGGATTCACCCTCACCCCGTCGGCGCAATCCCCGCG < 1:655700/300‑1 TGTTCGCACCTTCCTTAGTTATTCATTTCCTGTCTCACTTTGCCTTAATACCCTACGTTAAATGTTACTAATTTGTTGCTTTTGATCACAATAAGAAAACAATATGTCGCTTTTGTGCGCATTTTTCAGAAATGTAGATATTTTTAGATTATGGCTACGAAATGAGCATCGCCATGTCACCCTACATCTAATAAGAGGATCGCTTCTGATGAATGCACTGACCGCAGTACAAAATAACGCTGTCGATTCAGGCCAGGACTATAGCGGATTCACCCTCACCCCGTCGGCGCAATCCCCGC > 2:26309/1‑299 TGTTCGCACCTTCCTTAGTTATTCATTTCCTGTCTCACTTTGCCTTAATACCCTACGTTAAATGTTACTAATTTGTTGCTTTTGATCACAATAAGAAAACAATATGTCGCTTTTGTGCGCATTTTTCAGAAATGTAGATATTTTTAGATTATGGCTACGAAATGAGCATCGCCATGTCACCCTACATCTAATAAGAGGATCGCTTCTGATGAATGCACTGAACGCCGTACAAAATAACGCTGTCGATTCAGGCCAGGACTATAGCGAATTCACCCTCACCCCGTCGGCGCAATCCCagc > 2:75653/1‑296 TTCGCACCTTCCTTAGTTATTCATTTCCTGTCTCACTTTGCCTTAATACCCTACGTTAAATGTTACTAATTTGTTGCTTTTGATCACAATAAGAAAACAATATGTCGCTTTTGTGCGCATTTTTCAGAAATGTAGATATTTTTAGATTATGGCTACGAAATGAGCATCGCCATGTCACCCTACATCTCATAAGAGGATCGCTTCTGATGAATGCACTGACCGCCGTACAAAATAACGCTGTCGATTCAGGCCAGGACTATAGCGGATTCACCCTCACCCCGTCGGCGCAATCCCCGCGTC < 2:497037/300‑1 TTCCTTAGTTATTCATTTCCTGTCTCACTTTGCCTTAATACCCTACGTTAAATGTTACTAATTTGTTGCTTTTGATCACAATAAGAAAACAATATGTCGCTTTTGTGCGCATTTTTCAGAAATGTAGATATTTTTAGATTATGGCTACGAAATGAGCATCGCCATGTCACCCTACATCTCATAAGAGGATCGCTTCTGATGAATGCACTGACCGCCGTACAAAATAACGCTGTCGATTCAGGCCAGGACTATAGCGGATTCACCCTCACCCCGTCGGCGCAATCCCCGCGTCTGCTGGA > 2:738124/1‑299 TTCCTTAGTTATTCATTTCCTGTCTCACTTTGCCTTAATACCCTACGTTAAATGTTACTAATTTGTTGCTTTTGATCACAATAAGAAAACAATATGTCGCTTTTGTGCGCATTTTTCAGAAATGTAGATATTTTTAGATTATGGCTACGAAATGAGCATCGCCATGTCACCCTACATCTAATAAGAGGATCGCTTCTGATGAATGCACTGACCGCAGTACAAAATAACGCTGTCGATTCAGGCCAGGACTATGGCGGATTCACCCTCACCCCGTCGGCGCAATCCCCGCGTCTGCTGGAA > 2:241414/1‑300 CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289826‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGTTATTCATTTCCTGTCTCACTTTGCCTTAATACCCTACGTTAAATGTTACTAATTTGTTGCTTTTGATCACAATAAGAAAACAATATGTCGCTTTTGTGCGCATTTTTCAGAAATGTAGATATTTTTAGATTATGGCTACGAAATGAGCATCGCCATGTCACCCTACATCTCATAAGAGGATCGCTTCTGATGAATGCACTGACCGCCGTACAAAATAACGCTGTCGATTCAGGCCAGGACTATAGCGGATTCACCCTCACCCCGTCGGCGCAATCCCCGCGTCTGCTGGAA > NC_000913/2788791‑2789086 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |