| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3095995 | 103 (1.080) | 5 (0.050) | 5/566 | 7.6 | 5.0% | coding (176/567 nt) | yggT | uncharacterized protein YggT |
| ? | NC_000913 | 3096266 = | 89 (0.970) | coding (447/567 nt) | yggT | uncharacterized protein YggT | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACGGCCAGGCCAACAGTCATCTGGTGAAGTTTCTCGGTAAGCAATTCC > NC_000913/3095969‑3096560 | aCTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAAtgggtg < 1:45177/299‑1 (MQ=255) gcgcCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGANTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGANCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGgat < 2:586831/300‑1 (MQ=255) gcgTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGgattgatt > 1:607429/1‑300 (MQ=255) gggCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGNCCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTc < 1:558875/300‑1 (MQ=255) ggCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTc > 2:654048/1‑299 (MQ=255) gcgcCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTctgctg > 1:97941/1‑296 (MQ=255) gcgcCTAGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTctgctg > 2:744095/1‑296 (MQ=255) 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gctgGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCNGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCaa > 1:164935/1‑300 (MQ=255) ggTTGCCTATATTCTCATTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAGAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCATGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAata < 2:141025/299‑1 (MQ=255) tataTTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTNGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGgtg < 2:569252/298‑1 (MQ=255) 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aGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGTTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAg < 2:467200/298‑1 (MQ=255) ttATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTAc < 1:335386/300‑1 (MQ=255) agcAAAGCCATCGTGTTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCATGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAg < 1:682405/298‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |