| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3095995 | 103 (1.080) | 5 (0.050) | 5/566 | 7.6 | 5.0% | coding (176/567 nt) | yggT | uncharacterized protein YggT |
| ? | NC_000913 | 3096266 = | 89 (0.970) | coding (447/567 nt) | yggT | uncharacterized protein YggT | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CTCTGGGAATGTCGGACGATATGGAAGCCGCCATTGCGGCAGGTAGCACGATGGTTCGTATCGGCACTGCAATTTTTGGTGCGCGTGATTACTCTAAAAAATAAGGAATTAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCATGGTGCTGTTATTACGCATCTGGATGCAGTGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCGCTGCTGGTTGCCTATATTCTCAGTTTTATCAAAGCCATCGTGCTGTTTAAAGTGGTGACCTTCCTGCCAATCATCTGGATTGCCGGTTTACTGATTCTGCTGAAAACCATCGGCCTGCTGATTTTCTGGGTCCTGCTGGTGATGGCGATTATGAGCTGGGTAAGCCAGGGGCGTAGCCCGATTGAATACGTGCTGATTCAGCTGGCCGATCCGCTGCTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTC > NC_000913/3095699‑3096293 | ctctGGGAATGTCGGACGATATGGAAGCCGCCATTGCGGCAGGTAGCACGATGGTTCGTATCGGCACTGCAATTTTTGGTGCGCGTGATTACTCTAAAAAATAAGGAATTAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACNTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCATGGTGCTGTTATTACGCATCTGGATGCAGTGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGcc > 2:558875/1‑300 (MQ=255) tgAATGTCTGACGATATGGAAGCCGCCATTGCGGCAGGTAGCACGATGGTTCGTATCGGCACGGCAATTTTTGGTGCGCGTGATTACTCTAAAAAATAAGGAATTAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACAGTCATTGAGCTGTATACCATGGTGCTGTTATTACGCATCTGGATGCAGTGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTTTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTg < 1:231044/299‑1 (MQ=255) gAATGTCGGACGATATGGAAGCCGCCATTGCGGCAGGTAGCACGATGGTTCGTATCTGCACTGCAATTTTTGGTGCGCGTGATTACTCTAAAAAATAAGGAATTAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCATGGTGCTGTTATTACGCATCTGGATGCAGTGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTg < 1:230816/299‑1 (MQ=255) gTCGGACGATATGGAAGCCGCCATTGCGGCAGGTAGCACGATGGTTCGTATCGGCACTGCAATTTTTGGTGCGCGTGATTACTCTAAAAAATAAGGAATTAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCATGGTGCTGTTATTACGCATCTGGATGCAGTGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAgc < 2:633866/300‑1 (MQ=255) gTCGGACGATATGGAAGCCGCCATTGCGGCAGGTAGCACGATGGTTCGTATCGGCACTGCAATTTTTGGTGCGCGTGATTACTCTAAAAAATAAGGAATTAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCATGGTGCTGTTATTAAGCATCTGGATGCAGTGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAgc < 1:70047/300‑1 (MQ=255) gTCGGACGATATGGAAGCCGCCATTGCGGCAGGTAGCACGATGGTTCGTATCGGCACTGCAATTTTTGGTGCGCGTGANTACTCTAAAAAATAAGGAATTAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCATGGTGCTGTTATTACGCATCTGGATGCAGTGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAgc < 1:556319/300‑1 (MQ=255) aCGATATGGAAGCCGCCATTGCGGCAGGTAGCACGATGGTTCGTATCGGCACTGCAATTTTTGGTGCGCGTGATTACTCTAAAAAAGAAGGAATTAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCNTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCATGGTGCTGTTATTACGCATCTGGATGCAGTGGGCTCATTTTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAgc < 2:242801/295‑1 (MQ=255) 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atatGGAAGCCGCCATTGCGGCAGGTAGCACGATGGTTCGTATCGGCACTGCAATTTTTGGTGCGCGTGATTACTCTAAAAAATAAGGAATTAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCATGGTGCTGTTATTACGCATCTGGATGCAGTGGGCTCATTGTGATTTTTACACCCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCAAATTGACAGCGCCTCgct > 2:518047/1‑300 (MQ=255) atatGGAAGCCGCCATTGCGGCAGGTAGCACGATGGTTCGTATCGGCACTGCAATTTTTGGTGCGCGTGATTACTCTAAAAAATAAGGAATTAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCATGGTGCTGTTATTACGCATCTGGATGCAGTGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCAGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAGCGCCTCgct > 2:5078/1‑300 (MQ=255) aataaaaGCCGCCATTGCGGCAGGTAGCACGATGGTTCGTATCGGCACTGCAATTTTTGGTGCGCGTGATTACTCTAAAAAATAAGGAATTAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCATGGTGCTGTTATTACGCATCTGGATGCAGTGGGCTCATTGTGATTTTTACAACCCCTTCTCACAGTTTGTAGTGAAGGTAACGCAGCCAATTATCGGGCCACTGCGCCGCGTTATTCCGGCAATGGGGCCAATTGACAgc > 1:522924/6‑291 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |