| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2765412 = | 115 (1.230) | 18 (0.230) | 11/500 | 4.5 | 15.6% | intergenic (‑259/+101) | abpA/yfjM | anti‑bacteriophage protein/protein YfjM |
| ? | NC_000913 | = 2765419 | 97 (1.220) | intergenic (‑266/+94) | abpA/yfjM | anti‑bacteriophage protein/protein YfjM | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TGCTTGGCGGCTACTCCGCCTGAATCGTTCGACTCCATTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GC‑‑‑‑‑‑‑‑ACTATGGCACT‑‑‑‑‑‑‑‑ATGGCACTATGGCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGATGCTCTTTGAGCAATGTCAACATCGCGTGTTCATGGCTTTCTATATTGTTGATGCCTTGCCCATCCGGACCCCACTCCTTATAGCTCATCATGATGGCTTGTTTTGGGCTCTCTGCTCGTTCTGTTTCGACGTAGAATTTTTTCTTGTCTGCTGGCGAATAATTAC > NC_000913/2765116‑2765709 | tGCTTGGCGGCTACTCCGCCTGAATCGTTCGACTCCATTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcac < 1:529050/300‑1 (MQ=255) ggcggcTACTCCGCCTGAATCGTTCGACTCCATTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCCGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcactat > 1:601468/1‑298 (MQ=255) ggcggcTACTCCGCCTGAATCGTTCGACTCCATTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAAACCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCAAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcactat > 1:224005/1‑298 (MQ=255) gACTCCAGTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGTAGATGTTATGACACAGTCCAAGCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTAGCAAGCTTGTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGTTTATATAACATACTGCCCCAACGAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTGCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gc‑‑‑‑‑‑‑‑actatggcact‑‑‑‑‑‑‑‑atggcactatgg < 2:651169/299‑1 (MQ=255) tCCATTTAGACATCCTTGACAATTTTTCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGGCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gc‑‑‑‑‑‑‑‑actatggcact‑‑‑‑‑‑‑‑atggcactatggcac < 2:330096/299‑1 (MQ=255) tCCATTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATTACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gc‑‑‑‑‑‑‑‑actatggcact‑‑‑‑‑‑‑‑atggcactatggcac < 2:722285/299‑1 (MQ=255) ccATTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCNATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGANTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gc‑‑‑‑‑‑‑‑actatggcact‑‑‑‑‑‑‑‑atggcactatggcacta > 2:577830/1‑300 (MQ=255) ccATTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAATGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gc‑‑‑‑‑‑‑‑actatggcact‑‑‑‑‑‑‑‑atggcactatggcacta > 1:604528/1‑300 (MQ=255) ccATTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gc‑‑‑‑‑‑‑‑actatggcact‑‑‑‑‑‑‑‑atggcactatggcacta > 2:624886/1‑300 (MQ=255) ccATTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCAAAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gc‑‑‑‑‑‑‑‑actatggcact‑‑‑‑‑‑‑‑atggcactatggcacta > 2:183600/1‑300 (MQ=255) aTTTAGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCCAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCACATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gc‑‑‑‑‑‑‑‑actatggcact‑‑‑‑‑‑‑‑atggcactatggcactat > 2:676947/1‑299 (MQ=255) tttAGACATCCTTGACAATTTTGCGAAAATTAAGTAGATGTTATGACACAGTCCAATCTGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gc‑‑‑‑‑‑‑‑actatggcact‑‑‑‑‑‑‑‑atggcactatggcac < 2:732356/295‑1 (MQ=255) aGACATCCGTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gc‑‑‑‑‑‑‑‑actatggcact‑‑‑‑‑‑‑‑atggcactatggcactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gcac < 2:681057/300‑1 (MQ=255) aTCCGTGACAATTTTTCTAAAATGAAGTAGATGTTATGACACAGTCCAAGCGGATCACTGTATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gc‑‑‑‑‑‑‑‑ac < 2:399193/264‑1 (MQ=255) gTGACAATTTTGCGAAAATTAAGGAGATGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gc‑‑‑‑‑‑‑‑actatggcact‑‑‑‑‑‑‑‑atggcactatggcactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gcactatggc < 1:174317/298‑1 (MQ=255) tGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGTAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAANTATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATNACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCACtatg‑‑‑‑‑‑‑‑gc‑‑‑‑‑‑‑‑actatggcact‑‑‑‑‑‑‑‑atggcactatggcactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcac > 2:567746/1‑273 (MQ=255) tGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAANTATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATNACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCACtatg‑‑‑‑‑‑‑‑gc‑‑‑‑‑‑‑‑actatggcact‑‑‑‑‑‑‑‑atggcactatggcactatg‑‑‑‑‑‑‑‑gcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcac > 2:560655/1‑273 (MQ=255) tGTTATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GC‑‑‑‑‑‑‑‑ACTATGGCACT‑‑‑‑‑‑‑‑ATGGCACTATGGCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGata > 1:359343/1‑300 (MQ=255) ttATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCCGGTATCCAGCTCTTCAGGATTCCAAAAATATTGTAACCCTGACGTATAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GC‑‑‑‑‑‑‑‑ACTATGGCACT‑‑‑‑‑‑‑‑ATGGCAATATGGCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGatagt > 2:324020/1‑298 (MQ=255) ttATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GC‑‑‑‑‑‑‑‑ACTATGGCACT‑‑‑‑‑‑‑‑ATGGCACTATGGCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGAtatt > 1:681454/1‑300 (MQ=255) ttATGACACAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTAGTAGGTATCACGCTTTTAAGGGTTCCACAAATATTGTAACCATGAAGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GC‑‑‑‑‑‑‑‑ACTATGGCACT‑‑‑‑‑‑‑‑CTGGCACTATGGCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATGGAACCGCAAGTGATTGTAATCACACTTGAtatt > 2:401412/1‑300 (MQ=255) 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acacAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATN‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GC‑‑‑‑‑‑‑‑ACTATGGCACT‑‑‑‑‑‑‑‑ATGGCACTATGGCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGat > 1:154967/1‑300 (MQ=255) acacAGTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GC‑‑‑‑‑‑‑‑ACTATGGCACT‑‑‑‑‑‑‑‑ATGGCACTATGGCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATaaa > 1:108290/1‑300 (MQ=255) 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gTCCAATCGGATCACTGCATCATCACCAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGCATCAAGCTTTTAAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GC‑‑‑‑‑‑‑‑ACTATGGCACT‑‑‑‑‑‑‑‑ATGGCACTATGGCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAAcaca > 2:220952/1‑300 (MQ=255) gTCCAATCGGATCACTGCATCATCAACAGTGATCTAAATACTTCACAGCCATTCTCGGTCGCAGGTATCAAGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GC‑‑‑‑‑‑‑‑ACTATGGCACT‑‑‑‑‑‑‑‑ATGGCACTATGGCACTATG‑‑‑‑‑‑‑‑GCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAAcaca > 1:61274/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |