| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 295,882 | IS2 (+) +5 bp | coding (1211‑1215/1401 nt) | intF ← | putative phage integrase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
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aCAAAGTACCAAAACTACGACGTAAACCGTGAAGGCTGATATGTGGTAACTCAGCCAGCACTAATGCTCTGTTGTGCGCTGAACGCGGCTCAATAATTTTGCCACTTTTACTGTTACTTCTGAAAACCCAACCCTCCTTATTTACGTCAGAATTTGGGGATTGCGCTAGTACATTTAACAATTCAGAAACATAAGGAGTGAGAGGGATGATACGTTCACCTTCGATCTTGTCTTTAATTCGCATGCTTGACCATTTGAAATCTACGTCTGACCAGCGAAGCGACGCAATTTCTTCACGc > 2:472952‑M1/2‑299 (MQ=255) aaaGtagactggcccactgaatctccagacaaccaatatcaattaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggagaacaagttgttc > 2:734263‑M1/1‑4 (MQ=255) aaGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaagaagtcttactgctgtcgccgccggagaacaggttgttcc > 2:78547‑M1/1‑3 (MQ=255) aaGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttccctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggagaacaggttgttcc < 2:757991‑M1/300‑298 (MQ=255) gTACCAAAACTACGACGTAAACCGTGAAGGCTGATATGTGGTAACTCAGCCAGCATTAATGCTCTGTTGTGCGCTGAACGCGGCTCAATAATTTTGCCACTTTTACTGTTACTTCTGAAAACCCAACCCTCCTTATTTACGTCAGAATTTGGGGATTGCGCTAGTACATTTAACAATTCAGAAACATAAGGAGTGAGAGGGATGATACGTTCACCTTCGATCTTGTCTTTAATTCGCATGCTTGACCATTTGAAATCTACGTCTGACCAGCGAAGCGACGCAATTTCTTCACGCCGAGCa > 1:644148/1‑300 (MQ=255) gTACCAAAACTACGACGTAAACCGTGAAGGCTGATATGTGGTAACTCAGCAAGCACTAATGCTCTGTTGTGCGCTGAACGCGGCTCAATAATTTTGCCACTTTTACTGTTACTTCTGAAAACCCAAACCTCCTTATTTACGTCAGAATTTGGGGATTGCGTTAGTACATTTAACAATTCAGAACAATAAGGAGTGAGAGGGATGATACGCTCACCTTCGATCTTGTCTTTAATTCGCATGCTTGACCATTTGACATCTACGTCTGACCAGCGAAGCGACGCCATTTCTTCACGCCGAgaa > 2:109285/1‑298 (MQ=255) | CTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATGAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGATCCATGTCTCAATTTTCTCGTGCCATTTTCGTAACAGATCTAACGGACGACGGCGATAGTGTTTTTCGGCAAGAGCGCTGGGTTTGTGTCCCATAATTTGAGCAACAATACCAGTGGGAACTTCAACCCACTCGGCCAAAGTACCAAAACTACGACGTAAACCGTGAAGGCTGATATGTGGTAACTCAGCCAGCACTAATGCTCTGTTGTGCGCTGAACGCGGCTCAATAATTTTGCCACTTTTACTGTTACTTCTGAAAACCCAACCCTCCTTATTTACGTCAGAATTTGGGGATTGCGCTAGTACATTTAACAATTCAGAAACATAAGGAGTGAGAGGGATGATACGTTCACCTTCGATCTTGTCTTTAATTCGCATGCTTGACCATTTGAAATCTACGTCTGACCAGCGAAGCGACGCAATTTCTTCACGCCGAGCA > NC_000913/295588‑296185 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |