| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 295,882 | IS2 (+) +5 bp | coding (1211‑1215/1401 nt) | intF ← | putative phage integrase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 295886 | 0 (0.000) | 120 (1.210) | 71/586 | 0.1 | 100% | coding (1211/1401 nt) | intF | putative phage integrase |
| ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
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aatccaCAAAGTACCAAAACTACGACGTAAACCGTGAAGGCTGATATGTGGTAACTCAGCCAGCACTAATGCTCTGTTGTGCGCTGAACGCGGCTCAATAATTTTGCCACTTTTACTGTTACTTCTGAAAACCCAACCCTCCTTATTTACGTCAGAATTTGGGGATTGCGCTAGTACATTTAACAATTCAGAAACATAAGGAGTGAGAGGGATGATACGTTCACCTTCGATCTTGTCTTTAATTCGCAt < 1:204632‑M1/243‑1 (MQ=255) aatccaCAAAGTACCAAAACTACGACGTAAACCGTGAAGGCTGATATGTGGTAACTCAGCCAGCACTAATGCTCTGTTGTGCGCTGAACGCGGCTCAATAATTTTGCCACTTTTACTGTTACTTCTGAAAACCCAACCCTCCTTATTTACGTCAGAATTTGGGGATTGCGCTAGTACATTTAACAATTCAGAAACATAAGGAGTGAGAGGGATGATACGTTCACCTTCGATCTTGTCTTTAATTCGCATGCTTGACCATTTGAAATCTACGTCTGACCAGCGAAGCGACGCAATttcttc < 1:393570‑M1/294‑1 (MQ=255) ggCCAAAGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggagaacaggtt < 1:599465‑M1/300‑293 (MQ=255) gCCAAAGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggagaacaggttg < 2:514295‑M1/300‑294 (MQ=255) aCAAAGTACCAAAACTACGACGTAAACCGTGAATGCTGATATGTGGTAACTCAGCCAGCACTAATGCTCTGTTGTGCGCTGAACGCGGCTCAATAATTTTGCCACTTTTACTGTTACTTCTGAAAACCCAACCCTCCTTATTTACGTCAGAATTTGGGGATTGCGCTAGTACATTTAACAATTCAGAAACATAAGGAGTGAGAGGGATGATACGTTCACCTTCGATCTTGTCTTTAATTCGCATGCTTGACCATTTGAAATCTACGTCTGACCAGCGAAGCGACGCAATTTCTTCACGc > 1:213309‑M1/2‑299 (MQ=255) aCAAAGTACCAAAACTACGACGTAAACCGTGAAGGCTGATATGTGGTAACTCAGCCAGCACTAATGCTCTGTTGTGCGCTGAACGCGGCTCAATAATTTTGCCACTTTTACTGTTACTTCTGAAAACCCAACCCTCCTTATTTACGTCAGAATTTGGGGATTGCGCTAGTACATTTAACAATTCAGAAACATAAGGAGTGAGAGGGATGATACGTTCACCTTCGATCTTGTCTTTAATTCGCATGCTTGACCATTTGAAATCTACGTCTGACCAGCGAAGCGACGCAATTTCTTCACGc > 2:472952‑M1/2‑299 (MQ=255) | CTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATGAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGATCCATGTCTCAATTTTCTCGTGCCATTTTCGTAACAGATCTAACGGACGACGGCGATAGTGTTTTTCGGCAAGAGCGCTGGGTTTGTGTCCCATAATTTGAGCAACAATACCAGTGGGAACTTCAACCCACTCGGCCAAAGTACCAAAACTACGACGTAAACCGTGAAGGCTGATATGTGGTAACTCAGCCAGCACTAATGCTCTGTTGTGCGCTGAACGCGGCTCAATAATTTTGCCACTTTTACTGTTACTTCTGAAAACCCAACCCTCCTTATTTACGTCAGAATTTGGGGATTGCGCTAGTACATTTAACAATTCAGAAACATAAGGAGTGAGAGGGATGATACGTTCACCTTCGATCTTGTCTTTAATTCGCATGCTTGACCATTTGAAATCTACGTCTGACCAGCGAAGCGACGCAATTTCTTCACGC > NC_000913/295588‑296179 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |