| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | NC_000913 | 2,466,385 | Δ10,215 bp | intS–torI | 16 genes intS, yfdG, yfdH, yfdI, yodE, yfdK, yfdM, yfdN, yfdO, yfdP, yfdQ, yfdR, yfdS, yfdT, ypdJ, torI |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 2466385 | 2476599 | 10215 | 99 [0] | [13] 112 | intS–torI | intS,yfdG,yfdH,yfdI,yodE,yfdK,yfdM,yfdN,yfdO,yfdP,yfdQ,yfdR,yfdS,yfdT,ypdJ,torI |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 2466384 | 0 (0.000) | 99 (1.130) | 65/558 | 0.1 | 100% | intergenic (+1/‑161) | argW/intS | tRNA‑Arg/prophage CPS‑53 integrase |
| ? | NC_000913 | 2476600 = | 0 (0.000) | intergenic (+90/+94) | torI/dsdC | prophage CPS‑53 recombination directionality factor and response regulator inhibitor/DNA‑binding transcriptional dual regulator DsdC | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GCACTCATGCAACACGAACTACAGCCTGATTCACTGGTTGATTTGAAATTCATCATGGCTGATACTGGCTTTGGTAAAACCTTCATCTATGACCGGATTAAGTCAGGCGACCTGCCAAAAGCCAAAGTTATCCACGGGCGAGCAAGATGGTTATATCGTGACCATTGTGAATTCAAAAATAAGCTCTTAAGCCGCGCCAATGGGTAAAATAGCGGGTAAAATATTTCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCAT‑CCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTTTGGCCACTGCCTGCCCGGTAATGTGGTGATGTAATAATGCTGATGGCATTTCACCGTCATATCGCCAAACGGCGCGACGAGCTCACCACTGGCAAGC‑CTTTTTTGTACCAGGCGTTTTCTTCCCATCGCCACCCCAATATGATTCATC > NC_000913/2476304‑2476895 | ggaacatctgctgcggcacctttatcttcgcgttaatgagtcatgcacagattcgtaacgacatgagcaataagcgtaaagcagaagcacnccaaaaagcagaacgtgcggaaaacattaagaaaaattataaaaacccggcataaatggcgagggtttaagcaatcgagcggcagcgtacttaccccgcactccattagcgggtatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCt < 2:555384‑M2/3‑1 (MQ=255) gaacatctgcggcggcacctttatcttcgcgttaatgagtcatgcacagattcgtaacgacatgagcaataagcgtaaagcagaagcacgccaaaaagcagaacgtgcggaaaacattaagaaaaattataaaaacccggcataaatggcgagggtttaagcaatcgagcggcagcgtacttaccccgcactccattagcgggtatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCtt > 2:455670‑M2/297‑300 (MQ=255) atctgcggcggcacctttatcgtctcgttaatgagtcatgcacagattcgtaacgacatgagcaataagcgtaaagcagaagcacgcaaaaaagcagaacgtgcggaaaacattaagaaaaagtataaaaacccggcataaatggcgagggtttaaacaatcgagcggcagcgtacttaccccgcactccattagcgggtatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggcgaattgcgggttcgattcctgcagggggcaccatCCTTgtgt < 2:458721‑M2/8‑1 (MQ=255) atctgcggcgacacctttatcttcgcgttaatgattcatgcacagattcgtaacgacatgagcaataagcgtaaagcagaagcacgccaaaaagcagaatgtgcggaaaacagtaagaaaaattataaaaacccggcataaatgtcgagggtttaagcaatcgagcggcagcgtacttaccccgcactccattagcgggtatactcatgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatCCTtgtg < 2:113245‑M2/7‑1 (MQ=255) 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gCAGGGGACACCAT‑CCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTTTGGCCACTGCCTGCCCGGTAATGTGGTGATGTAATAATGCTGATGGCNTTTCACCGTCATATCGCCAAACGGCGCGACGAGCTCACCACTGGCAAGC‑CTTTTTTGTACCAGGCGTTTTCTTCCCATCGCCACCCCAat > 2:564819/1‑300 (MQ=255) aGGGGACACCAT‑CCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTTTGGCCACTGCCTGCCCGGTAATGTGGTGATGTAATAATGCTGATGGCATTTCACCGTCATATCGCCAAACGGCGCGACGAGCTCACCACTGGCAAGC‑CTTTTTTGTACCAGGCGTTTTCTTCCCATCGCCACCCCAatat < 1:199212/300‑1 (MQ=255) aGGGGACACCAT‑CCTTGTGTTTAGCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCTTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTTTGGCCACTGCCTGCCCGGTAATGTGGTGATGTAATAATGCTGATGGCATTTCACCGTCATATCGCCAAACGGCGCGACGAGCTCACCACTGGCAAGC‑CTTTTTTGTACCAGGCGTTTTCTTCCCATCGCCACCCCAatat < 2:394895/300‑1 (MQ=255) ggggACACCAT‑CCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATNCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGNCAGATAATAAACGCTTCAATTTTTGGCCACTGCCTGCCCGGTAATGTGGTGATGTAATAATGCTGATGGCATTTCACCGTCATATCGCCAAACGGCGCGACGAGCTCACCACTGGCAAGC‑CTTTTTTGTACCAGGCGTTTTCTTCCCATCGCCACCCCAatat > 2:539266/1‑299 (MQ=255) ggACACCAT‑CCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTTTGGCCACTGCCTGCCCGGTAATGTGGTGATGTAATAATGCTGATGGCATTTCNACGTCATATCGCCAAACGGCGCGACGAGCTCACCACTGGCAAGC‑CTTTTTTGTACCAGGCGTTTTCTTCCCATCGCCACCCCAATATGAt > 2:574447/1‑300 (MQ=255) t‑CCTTGTGTTTATTCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGCACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGCTCTCTTAGCCAGATAATAAAAGCTTCAATTTTTGGCCACTGCCTGCCCGGTAGTGTGGTGATGTAATAATGCTGATGGCATTTCACATTAATCTAGCACAACGGCGAGACGAGCTCACCACTGGCAAAC‑CTCTTTTATACCAGGCGTTttct > 2:318585/1‑269 (MQ=255) | GCACTCATGCAACACGAACTACAGCCTGATTCACTGGTTGATTTGAAATTCATCATGGCTGATACTGGCTTTGGTAAAACCTTCATCTATGACCGGATTAAGTCAGGCGACCTGCCAAAAGCCAAAGTTATCCACGGGCGAGCAAGATGGTTATATCGTGACCATTGTGAATTCAAAAATAAGCTCTTAAGCCGCGCCAATGGGTAAAATAGCGGGTAAAATATTTCTCACATCTAAAAAACACCATTCCAATCAATCCCCTGCTGCTTCAAGTAGATGTCTGCAGGGGACACCAT‑CCTTGTGTTTATCCCTAAAACCACATAAAAACCGTAAATTAAATTCGAACTAGCAGGCCGAATAAGGCACACCAGGAACTCGTGGTTTTATTCATTATGAAGTGGTTTTTACCTGTTCTCTTAGCCAGATAATAAACGCTTCAATTTTTGGCCACTGCCTGCCCGGTAATGTGGTGATGTAATAATGCTGATGGCATTTCACCGTCATATCGCCAAACGGCGCGACGAGCTCACCACTGGCAAGC‑CTTTTTTGTACCAGGCGTTTTCTTCCCATCGCCACCCCAATATGATTCATC > NC_000913/2476304‑2476895 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |