| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,452,057 | IS2 (–) +5 bp | coding (276‑280/753 nt) | yfcS ← | putative fimbrial chaperone YfcS |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 2452061 | 0 (0.000) | 65 (0.930) | 41/590 | 0.4 | 100% | coding (276/753 nt) | yfcS | putative fimbrial chaperone YfcS |
| ? | NC_000913 | 2996361 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
CTGGATTACCGTTTTTCTGCGCACTGGCGTTGCTGATAATCACGTAGTACGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTTTTCATACTGACCTTTTCCAGCGCCTTTGGTCGCCAGAACAACTTGATACGCGTTTGCAGCGCGATTTGCAGGGTATTGGGTTTGTTTGATTTTGGCGGGATCTCGCGCACGTTAAAGTAGAACATGCTTTCACGATCGGCTGGCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGGTGATCTTGTTACCCTTTTCATCTTCAATCCAGCTTTGAGCCAGATAAGGGAGTTTCGGATCGTTATTACGCAGCGTCACGCTGATTGATTTGTCGCTTTCATTAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAGCAGTAACGCCAGCGTCATAGCACCCAATTTGGCAGAGCAAAGTAAATCAGACATGGATCATTCCTTAAT > NC_000913/2451760‑2452351 | ggaacaacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcaattatttaagtgatattggttgtctggagattcagagggccagtctaCCt > 2:102544‑M2/298‑300 (MQ=255)cTGGATTACCGTTTTTCTGCGCACTGGCGTTGCTGATAATCACGTAGTACGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTTTTCATACTGACCTTTTCCAGCGCCTTTGGTCGCCAGAACAACTTGATACGCGTTTGCAGCGCGATTTGCAGGGTATTGGGTTTGTTTGATTTTGGCGGGATCTCGCGCACGTTAAAGTAGAACATGCTTTCACGATCGGCTGGCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCt > 1:419135/1‑300 (MQ=255) aacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCTGccc > 1:264724‑M2/293‑299 (MQ=255) ccGTTTTTCTGCGCACTGGCGTTGCTGATAATCACGTAGTACGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTTTTCATACTGACCTTTTCCAGCGCCTTTGGTCGCCAGAACAACTTGATACGCGTTTGCAGCGCGATTTGCAGGGTATTGGGTTTGTTTGATTTTGGCGGGATCTCGCGCACGTTAAAGTAGAACATGCTTTCACGATCGGCTGGCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCTGCtggatt > 1:508747‑M1/1‑294 (MQ=255) gcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgatggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAAt < 1:70174‑M2/21‑1 (MQ=255) cagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGtt > 1:158310‑M2/270‑299 (MQ=255) cagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgcgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGtt > 1:373379‑M2/270‑299 (MQ=255) 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2:504004‑M1/300‑259 (MQ=255) gatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGGTGATCTTGTTACCCTTTTCATCTTCAATCCAGCTTTGAGCCAGATAAGGGAGTTTCGGATCGTTATTACGCAGCGTCACGCTGATTGATTTGTCGCTTTCATTAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAGCAGTAACGCCAGCGTCATAGCACCCAATTTGGCAGAGc > 1:523211‑M2/37‑300 (MQ=255) gattcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGGTGATCTTGTTACCCTTTTCATCTTCAATCCAGCTTTGAGCCAGATAAGGGAGTTTCGGATCGTTATTACGCAGCGTCACGCTGATTGATTTGTCGCTTTCATTAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAGCAGTAACGCCAGCGTCATAGCACCCAATTTGGCAGAGCAAAGTAAATCAGACAt > 2:507389‑M2/20‑299 (MQ=255) tcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGTTGATCTTGTTACCCTTTTCATCTTCAATCCAGCTTTGAGCCAGATAAGGGAGTTTCGGATCGTTATTACGCAGCGTCACGCTGATTGATTTGTCGCTTTCATTAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAGCAGTAACGCCAGCGTCATAGCACCCAATTTGGCAGAGCAAAGTAAATCAGACATGGAt < 2:158310‑M2/284‑1 (MQ=255) tcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGGTGATCTTGTTACCCTTTTCATCTTCAATCCAGCTTTGAGCCAGATAAGGGAGTTTCGGATCGTTATTACGCAGCGTCACGCTGATTGATTTGTCGCTTTCATTAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAGCAGTAACGCCAGCGTCATAGCACCCAATTTGGCAGAGCAAAGTAAATCAGACATGGAt < 2:264724‑M2/284‑1 (MQ=255) tcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGGTGATCTTGTTACCCNTTTCATCTTCAATCCAGCTTTGAGCCAGATAAGGGAGTTTCGGATCGTTATTACGCAGCGTCACGCTGATTGATTTGTCGCTTTCATTAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAGCAGTAACGCCAGCGTCATAGCACCCAATTTGGCAGAGCAAAGTAAATCAGACATGGAt < 2:428309‑M2/284‑1 (MQ=255) tCCCTGCACTTCCCCCCGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacacgcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactctgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctatgcaaggttctttgctgccgttaacctgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttgctctcaggactccgcaccgccgtgttcttaggttca > 2:540247‑M1/1‑19 (MQ=255) gtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGGTGATCTTGTTACCCTTTTCATCTTCAATCCAGCTTTGAGCCAGATAAGGGAGTTTCGGATCGTTATTACGCAGCGTCACGCTGATTGATTTGTCGCTTTCATTAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAGCAGTAACGCCAGCGTCATAGCACCCAATTTGGCAGAGCAAAGTAAATCAGACATGGATCATTCCTTAAt > 2:524982‑M2/6‑300 (MQ=255) ctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGGTGATCTTGTTACCCTTTTCATCTTCAATCCAGCTTTGAGCCAGATAAGGGAGTTTCGGATCGTTATTACGCCGCGTCAAGCTGATTGATTTGTCGCTTTCATTAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTAAAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAGCAGTAACGCCAGCGTCCTAGCACCCAATTTGGCCGAGCAAAGTAAATcagacctggataatgcattaa > 2:244889‑M2/4‑287 (MQ=255) | CTGGATTACCGTTTTTCTGCGCACTGGCGTTGCTGATAATCACGTAGTACGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTTTTCATACTGACCTTTTCCAGCGCCTTTGGTCGCCAGAACAACTTGATACGCGTTTGCAGCGCGATTTGCAGGGTATTGGGTTTGTTTGATTTTGGCGGGATCTCGCGCACGTTAAAGTAGAACATGCTTTCACGATCGGCTGGCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGGTGATCTTGTTACCCTTTTCATCTTCAATCCAGCTTTGAGCCAGATAAGGGAGTTTCGGATCGTTATTACGCAGCGTCACGCTGATTGATTTGTCGCTTTCATTAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAGCAGTAACGCCAGCGTCATAGCACCCAATTTGGCAGAGCAAAGTAAATCAGACATGGATCATTCCTTAAT > NC_000913/2451760‑2452351 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |