| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,452,057 | IS2 (–) +5 bp | coding (276‑280/753 nt) | yfcS ← | putative fimbrial chaperone YfcS |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 2452061 | 0 (0.000) | 65 (0.930) | 41/590 | 0.4 | 100% | coding (276/753 nt) | yfcS | putative fimbrial chaperone YfcS |
| ? | NC_000913 | 2996361 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TTACCGTTTTTCTGCGCACTGGCGTTGCTGATAATCACGTAGTACGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTTTTCATACTGACCTTTTCCAGCGCCTTTGGTCGCCAGAACAACTTGATACGCGTTTGCAGCGCGATTTGCAGGGTATTGGGTTTGTTTGATTTTGGCGGGATCTCGCGCACGTTAAAGTAGAACATGCTTTCACGATCGGCTGGCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGGTGATCTTGTTACCCTTTTCATCTTCAATCCAGCTTTGAGCCAGATAAGGGAGTTTCGGATCGTTATTACGCAGCGTCACGCTGATTGATTTGTCGCTTTCATTAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAGCAGTAACGCCAGCGTCATAGCACCCAATTTGGCAGAGCAAAGTAAATCAGACATGGATCATTCCTTAAT > NC_000913/2451765‑2452351 | aacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCTGccc > 1:264724‑M2/293‑299 (MQ=255) ccGTTTTTCTGCGCACTGGCGTTGCTGATAATCACGTAGTACGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTTTTCATACTGACCTTTTCCAGCGCCTTTGGTCGCCAGAACAACTTGATACGCGTTTGCAGCGCGATTTGCAGGGTATTGGGTTTGTTTGATTTTGGCGGGATCTCGCGCACGTTAAAGTAGAACATGCTTTCACGATCGGCTGGCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCTGCtggatt > 1:508747‑M1/1‑294 (MQ=255) ctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCTGCCCGTTcatcat > 1:525852‑M2/285‑300 (MQ=255) gcACTGGCGTTGCTGATAATCACGTAGTACGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTTTTCATACTGACATTTTCCAGCGCCTTTGGTCGCCAGAACAACTTGATACGCGTTTGCAGCGCGATTTGCAGGGTATTGGGTTTGTTTGATTTTGGCGGGATCTCGCGCACGTTAAAGTAGAACATGCTTTCACGATCGGCTGGCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCTGCtggatgtgcccctatat < 1:480122‑M1/299‑18 (MQ=255) cagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGtt > 1:158310‑M2/270‑299 (MQ=255) cagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgcgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGtt > 1:373379‑M2/270‑299 (MQ=255) aTCACGTAGTACGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTTTTCATACTGACCTTTTCCAGCGCCTTTGGTCGCCAGAACAACTTGATACGCGTTTGCAGCGCGATTTGCAGGGTATTGGGTTTGTTTGATTTTGGCGGGATCTCGCGCACGTTAAAGTAGAACATGCTTTCACGATCGGCTGGCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCTGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatca < 2:261925‑M1/300‑37 (MQ=255) 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gtaCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTTTTCATACTGACCTTTTCCAGCGCCTTTGGTCGCCAGAACAACTTGATACGCGTTTGCAGCGCGATTTGCAGGGTATTGGGTTTGTTTGATTTTGGCGGGATCTCGCGCACGTTAAAGTAGAACATGCTTTCACGATCGGCTGGCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCTGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccc > 1:433328‑M1/1‑256 (MQ=255) gcttgcgccagagaaataactggcgggctgctacaccatgttgccgggcaacgatgtagaccgtcatccccggttcaaagctctgcggaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggcccgaagacatcaatcatctggtctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttattgaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCTGCCCGGGCAGCATTGAAGCGATGTGTGGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACgg < 1:495120‑M2/55‑1 (MQ=255) gcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACgg < 1:495140‑M2/55‑1 (MQ=255) ttGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTTTTCATACTGACCTTTTCCAGCGCCTTTGGTCGCCAGAACAACTTGATACGCGTTTGCAGCGCGATTTGCAGGGTATTGGGTTTGTTTGATTTTGGCGGGATCTCGCGCACGTTAAAGTAGAACATGCTTTCACGATCGGCTGGCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCTGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaag < 1:548593‑M1/300‑53 (MQ=255) gggTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTTTTCATACTGACCTTTTCCAGCGCCTTTGGTCGCCAGAACAACTTGATACGCGTTTGCAGCGCGATTTGCAGGGTATTGGGTTTGTTTGATTTTGGCGGGATCTCGCGCACGTTAAAGTAGAACATGCTTTCACGATCGGCTGGCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCTGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcc > 1:51902‑M1/1‑246 (MQ=255) gggTTATTGACGGTAAATGCCTGAACGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTTTTCATACTGACCTTTTCCAGCGCCTTTGGTCGCCAGAACAACTTGATACGCGTTTGCAGCGCGATTTGCAGGGTATTGGGTTTGTTTGATTTTGGCGGGATCTCGCGCACGTTAAAGTAGAACATGCTTTCACGATCGGCTGGCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCTGCtggatttgcacctatatttccagacatctgttatcaattaacccattccaagcc > 2:308813‑M1/1‑246 (MQ=255) gTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTTTTCATACTGACCTTTTCCAGCGCCTTTGGTCGCCAGAACAACTTGATACGCGTTTGCAGCGCGATTTGCAGGGTATTGGGTTTGTTTGATTTTGGCGGGATCTCGCGCACGTTAAAGTAGAACATGCTTTCACGATCGGCTGGCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCTGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcaga > 1:178290‑M1/1‑234 (MQ=255) tGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTTTTCATACTGACCTTTTCCAGCGCCTTTGGTAGCCAGAACAACTTGATACGCGTTTGCAGCGCGATTTGCAGGGTATTGGGTTTGTTTGATTTTGGCGGGATCTCGCGCACGTTAAAGTAGAACATGCTTTCACGATCGGCTGGCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCTGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattc > 2:493422‑M1/1‑229 (MQ=255) tggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGGTGATCTTGTTACCCTTTTc < 1:317790‑M2/79‑1 (MQ=255) 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gtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGGTGATCTTGTTACCCTTTTCATCTTCAATCCAGCTTTGAGCCAGATAAGGGAGTTTCGGATCGTTATTACGCAGCGTCACGCTGATTGATTTGTCGCTTTCATTAAATATCAACCGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAAATGGTAGCGCTAAGCAGTAACGCCAGCGTCATAGCACCCAATTTGGCa > 2:75809‑M2/39‑298 (MQ=255) ggCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCTGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccancgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttc < 2:178290‑M1/300‑259 (MQ=255) ggCAATTTGTTGATATCCGGCATCCCCTGCACTTTTACCTGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatgacaagcccgctgccgcagatattcccttggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttc < 2:504004‑M1/300‑259 (MQ=255) gattcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGGTGATCTTGTTACCCTTTTCATCTTCAATCCAGCTTTGAGCCAGATAAGGGAGTTTCGGATCGTTATTACGCAGCGTCACGCTGATTGATTTGTCGCTTTCATTAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAGCAGTAACGCCAGCGTCATAGCACCCAATTTGGCAGAGCAAAGTAAATCAGACAt > 2:507389‑M2/20‑299 (MQ=255) tcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGTTGATCTTGTTACCCTTTTCATCTTCAATCCAGCTTTGAGCCAGATAAGGGAGTTTCGGATCGTTATTACGCAGCGTCACGCTGATTGATTTGTCGCTTTCATTAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAGCAGTAACGCCAGCGTCATAGCACCCAATTTGGCAGAGCAAAGTAAATCAGACATGGAt < 2:158310‑M2/284‑1 (MQ=255) tcagggggccagtctaCCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGGTGATCTTGTTACCCNTTTCATCTTCAATCCAGCTTTGAGCCAGATAAGGGAGTTTCGGATCGTTATTACGCAGCGTCACGCTGATTGATTTGTCGCTTTCATTAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAGCAGTAACGCCAGCGTCATAGCACCCAATTTGGCAGAGCAAAGTAAATCAGACATGGAt < 2:428309‑M2/284‑1 (MQ=255) 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TTACCGTTTTTCTGCGCACTGGCGTTGCTGATAATCACGTAGTACGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTTTTCATACTGACCTTTTCCAGCGCCTTTGGTCGCCAGAACAACTTGATACGCGTTTGCAGCGCGATTTGCAGGGTATTGGGTTTGTTTGATTTTGGCGGGATCTCGCGCACGTTAAAGTAGAACATGCTTTCACGATCGGCTGGCAATTTGTTGATATCCGGCATTCCCTGCACTTTTACCTGCCCGTTCATCATTGAATCGATGCGTTGCACTGGCGGCAGCACAGTTAACGGCGAGGTGATCTTGTTACCCTTTTCATCTTCAATCCAGCTTTGAGCCAGATAAGGGAGTTTCGGATCGTTATTACGCAGCGTCACGCTGATTGATTTGTCGCTTTCATTAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAGCAGTAACGCCAGCGTCATAGCACCCAATTTGGCAGAGCAAAGTAAATCAGACATGGATCATTCCTTAAT > NC_000913/2451765‑2452351 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |