| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2817942 | 69 (0.780) | 6 (0.070) | 6/548 | 6.2 | 9.2% | intergenic (‑82/+117) | argQ/argZ | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
| ? | NC_000913 | 2818492 = | 54 (0.650) | noncoding (58/77 nt) | argV | tRNA‑Arg | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTA‑ATACCGCTATCTCTTCGA‑TACCTTC‑ATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATC > NC_000913/2817647‑2818206 | aagaTGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTA‑ATACCGCTATCTCTTCGA‑TACCTTC‑ATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTc < 1:251402/300‑1 (MQ=255) aTCCGGGAGGGTGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCTTGCGTTTA‑ATACCGCTATCTCTTCGA‑TACCTTC‑GTTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACCTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCTGGAGGATTACTCGCCTTGCGGc < 2:339311/300‑1 (MQ=255) cGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTA‑ATACCGCTATCTCTTCGA‑TACCTTC‑ATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGCTACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGCTTACTCGCCTTGCGGCt > 1:372184/1‑298 (MQ=255) cTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTA‑ATACCGCTATCTCTTCGA‑TACCTTC‑ATTGCTAAAGGCTACGGAGAATATGGTGCCTCCGGGCGGATTCGAACCTACGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTAATGCTGATATTGCTACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTACGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGTGcc > 2:193560/1‑300 (MQ=18) tCACTTACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTA‑ATACCGCTATCTCTTCGA‑TACCTTC‑CTTGCTGAAGGTTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGcc < 2:447185/299‑1 (MQ=255) tCACTGACGTTCTCCCTTCGTGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTA‑ATACCGCTATCTCTTCGA‑TACCTTC‑CTTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGcc < 2:447306/299‑1 (MQ=255) tCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTA‑ATACCGCTATCTCTTCGA‑TACCTTC‑ATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCCACTGCTGCTATTGATACCGCT‑CCTAAAGCAATGTCAATTCAGGGGTGGTGCATCCGGGAGGGTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCtt > 1:368327/1‑293 (MQ=18) 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gTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTAGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGACCCTCCGACCTCTCGGTTc > 1:322531/1‑279 (MQ=255) gTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTAATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCa > 1:94059/1‑299 (MQ=255) gTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCATAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCa > 1:408929/1‑299 (MQ=255) gTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTAATATTGATACCGCTCAC‑AAAGCCATCTCAATTAAGAGATGGTGCCTCCGGGAGGATTCCTCGCCTTGTGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCt > 2:334773/1‑176 (MQ=17) gTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTACTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAGTGCCGCTACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGaaagtacgtagaa < 2:460018/235‑12 (MQ=14) ttCGTAGCCGAGTACTCTATCCATCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGc < 1:45938/300‑1 (MQ=255) tAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCNCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGG‑Tg > 2:487115/1‑175 (MQ=255) tAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGG‑Tg < 1:487115/175‑1 (MQ=255) tAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTAG‑TGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGaaagtctgtagaa > 1:445283/1‑219 (MQ=11) gCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCt > 1:618658/1‑300 (MQ=255) gCCGAGNACTCTATCCAGCTGAGCTACGGAGGCATCGGGAAAATTTATTCTACTGCTGATATTGATACCACT‑ACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGc < 2:508599/142‑1 (MQ=17) cGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTCCTTCCTCTACCTATTCGCTACCTTAATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGTTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTAc > 1:524711/1‑300 (MQ=255) aGTACGCTATCCAGCGGAGCTGCGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGTGGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTTCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCGGAGCTACgg < 1:385060/300‑1 (MQ=255) aCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAATGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGCACCTCCGACTGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGc > 2:44912/1‑292 (MQ=255) aCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCCCG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATACGGGGGGATTCGAACATCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGAt > 1:680225/1‑299 (MQ=255) ctATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATcc > 1:604794/1‑281 (MQ=255) ctATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCCCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATcc < 2:604794/281‑1 (MQ=255) ctATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAACTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAACAACGTTCTCCTCCCTGG‑TGCCTGCGGTTATTTCCGCCCCCTCTTCAATACCTTCATTGCTGAAggtc > 2:323670/1‑208 (MQ=14) gATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTAG‑TGCCTGCGGTTACTCCCGCTACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGaa > 2:385167/1‑189 (MQ=17) aaCTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCACTTAGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTCCTCTATCCAGCTGCGCTACGGATGc > 2:672539/1‑267 (MQ=255) gctgATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTCAAGCACCGTTCTCATCCCTAG‑TACCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCCTCCGGGAGGGTTCGACCCTCCAACCGCCCGGTTCGCAACCGAGTACCCTaccaaac > 2:165845/1‑234 (MQ=18) actaAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTACTTCCGCCACCTCTTCAATACCTTCATTGCTGAAGAt > 2:142839/1‑148 (MQ=255) actaAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGTAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGc > 1:340324/1‑205 (MQ=255) actaAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGTAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGc < 2:340324/205‑1 (MQ=255) cAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTAGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCAACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATc > 1:379621/1‑294 (MQ=255) agagATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGACTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATCGCTGaa > 1:536730/1‑126 (MQ=255) | AAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTA‑ATACCGCTATCTCTTCGA‑TACCTTC‑ATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCT‑ACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAG‑TGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATC > NC_000913/2817647‑2818206 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |