| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,263,422 | IS30 (–) +2 bp | coding (238‑239/1209 nt) | tdcD ← | propionate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3263422 = | 9 (0.080) | 122 (1.070) | 75/598 | 0.2 | 93.1% | coding (239/1209 nt) | tdcD | propionate kinase |
| ? | NC_000913 | = 4508679 | NA (NA) | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
GCGACGTGCCGTGGAAACCATAACGGCGTACACCTAACTCTTCATAATATTTCCACGGCAGGCCGTATAAATAAGCTTCCGGAGCCATCGTCTGGTGGAAACTGGTATCAAATACCGCCACCTGAGTTACGCCCGGAAATAATTGCTGCGCCGATTCAATACCACTTAAATTGGCGTAATTATGCAGGGGTGCCAGTGGAGAAACGCGACGGATATTATCAATGACTTCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAACCGGAAATTCATTCATCTCTTTTCTCATCCTGAGTTACGGATTAAAACAGTTTGTATACGATGTTCAGGATG > NC_000913/3263126‑3263716 | acgaatgctcattttggctgacaaaccggctcgtatctcctcgcgctcagacattgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcattgggttctatgccaccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgtgttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaacac > 2:17352‑M1/297‑300 (MQ=255) aCGTGCCGTGGAAACCATAACGGCGTACACCTAACTCTTCATAATATTTCCACGGCAGGCCGTATAAATAAGCTTCCGGAGCCATCGTCTGGTGGAAACTGGTATCAAATACCGCCACCTGAGTTACGCCCGGAAATAATTGCTGCGCCGATTCAATACCACTTAAATTGGCGTAATTATGCAGGGGTGCCAGTGGAGAAACGCGACGGATATTATCAATGACTTCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACtgtag > 1:480856‑M2/1‑295 (MQ=255) tgctcattttggctgacaaaccagctcgtatctcctcgcgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaACACTGTCa > 2:789669‑M1/292‑300 (MQ=255) ggCGTACACCTAACTCTTCATAATATTTCCACGGCAGGCCGTATAAATAAGCTTCCGGAGCCATCGTCTGGTGGAAACTGGTATCAAATACCGCCACCTGAGTTACGCCCGGAAATAATTGCTGCGCCGATTCAATACCACTTAAATTGGCGTAATTATGCAGGGGTGCCAGTGGAGAAACGCGACGGATATTATCAATGACTTCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACtgtagattcaatctgtcaatgcaaca < 1:525862‑M2/300‑27 (MQ=255) 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gATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACtgtagattcaacctgtcaatgcaacacccctttcaattacctctttcgttgttttgaacttcagtgtctttctcggtctgttgtttagctgagcagcaaccagatctagttcatgttgagtatattgggcaagacatgtctttttaggaaagtactgccgaattagcccatttgtgttctcatttgttccccgctgccaaggactctgaggatcgcagaagtaaactttaacgccggtgctgacagtaaattctagatgtctggccagttccattc > 2:371454‑M2/1‑24 (MQ=255) ttgaccaattgaatctacaACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTNCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAACCGGAAATTCATTCATCTCTTTTCTCNTCCTGAGTTACGGATTAAAACAGTTTGtata > 2:659765‑M1/20‑300 (MQ=255) ccaattgaatctacaACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAACCGGAAATTCATTCATCTCTTTTCTCATCCTGAGTTACGGATTAAAACAGTTTGTATACGAt > 1:570668‑M1/16‑300 (MQ=255) ggCCAATTAAGTCCACtgtagattcaacctgtcaatgcaacacccctttcaattacctctttcggtgttttgaacttcagtgtctttctcggtctgttgtttagctgagcagcaatcagatctagtttatgttgagtatattgggcaagacatgtctttgtaggaaagtactgccgaattagcccatttgtgttctcatttgttccccactgccaaggactctgaggatcgcagaagtaaactttaacgccggtgctgacagtaaattctagatgtctggccagttccattcctctgtcc > 2:138223‑M2/1‑16 (MQ=255) aattgaatctacaACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAACCGGAAATTCATTCATCTCTTTTCTCATCCTGAGTTACGGATTAAAACAGTTTGTATACGATGt > 1:726571‑M1/14‑300 (MQ=255) aTTAATGCCACtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttcaattatctctttcggtgttttgaacttcagtgtctttctcggtctgttgtttagctgagcagcaaccagatctagttcatgttgagtatattgggcaagacatgtctttttaggaaagtactgccgaattagcccatttgtgttctcatttgttccccgctgccaaggactctgaggatcgcagaagtaaactttaacgccggtgctgacagtaaattctagatgtctggccagttccattcctctgtcccatgt > 1:333035‑M2/1‑11 (MQ=255) 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GCGACGTGCCGTGGAAACCATAACGGCGTACACCTAACTCTTCATAATATTTCCACGGCAGGCCGTATAAATAAGCTTCCGGAGCCATCGTCTGGTGGAAACTGGTATCAAATACCGCCACCTGAGTTACGCCCGGAAATAATTGCTGCGCCGATTCAATACCACTTAAATTGGCGTAATTATGCAGGGGTGCCAGTGGAGAAACGCGACGGATATTATCAATGACTTCATCGGTAATAATGGCGGACTCGGTAAAAATACTGCCGCCGTGAGCGATGCGGTGGCCAATTAAGGCCACACTGTCATTTAAATTCCGTTTTTCCAGTTCAAATGCAATTGCCTTCAATGCACCTTCGTAGCTGTGGTGAGCCAGCGGTGCTGGCTCTCCCCCATTTACGGATAAGAATGCATTTTCCGAGTTAATACCGTCGGCAATACCTGACATTAATACTTCACAGTCGCTGGCATCGAGCACGGAAAACTTAATCGAAGACGAACCACAGTTAATAACCAAAACAACCGGAAATTCATTCATCTCTTTTCTCATCCTGAGTTACGGATTAAAACAGTTTGTATACGATGTTCAGGATG > NC_000913/3263126‑3263716 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |