| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,263,422 | IS30 (–) +2 bp | coding (238‑239/1209 nt) | tdcD ← | propionate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3263422 = | 9 (0.080) | 122 (1.070) | 75/598 | 0.2 | 93.1% | coding (239/1209 nt) | tdcD | propionate kinase |
| ? | NC_000913 | = 4508679 | NA (NA) | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
ATCACTGACATGGGACAGAGGAATGGAACTGGCCAGACATCTAGAATTTACTGTCAGCACCGGCGTTAAAGTTTACTTCTGCGATCCTCAGAGTCCTTGGCAGCGGGGAACAAATGAGAACACAAATGGGCTAATTCGGCAGTACTTTCCTAAAAAGACATGTCTTGCCCAATATACTCAACATGAACTAGATCTGGTTGCTGCTCAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1470221‑1470516‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGCCTTAATTGGCCACCGCATCGCTCACGGCGGCAGTATTTTTACCGAGTCCGCCATTATTACCGATGAAGTCATTGATAATATCCGTCGCGTTTCTCCACTGGCACCCCTGCATAATTACGCCAATTTAAGTGGTATTGAATCGGCGCAGCAATTATTTCCGGGCGTAACTCAGGTGGCGGTATTTGATACCAGTTTCCACCAGACGATGGCTCCGGAAGCTTATTTATACGGCCTGCCGTGGAAATATTATGAAGAGTTAGGTGTACGCCGTTATGGTTTCCACGGCACGT < NC_000913/3263423‑3263129 ATCACTGACATTGTACAGAGGAATGGAACTGGCCAGACATCTAGAATTTACTGTCAGCACCGGCGTTAAAGTTTACTTCTGCGATCCTCAGAGTCCTTGGCAGCGGGGAACAAATGAGAACACAAATGGGCTAATTCGGCAGTACTTTCCTAAAAAGACATGTCTTGCCCAATATACTCAACATGAACTAGATCTGGTTGCTGCTCAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGTGG < 2:116177/300‑1 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GCATTGACAGATTGAATCTACAGTGGCCTTAATTGGCCACCGCATCGCTCACGGCGGCAGTATTTTTACCGAGTCCGCCATTATTACCGATGAAGTCATTGATAATATCCGTCGCGTTTCTCCACTGGCACCCCTGCATAATTACGCCAATTTAAGTGGTATTGAATCGGCGCAGCAATTATTTCCGGGCGTAACTCAGGTGGCGGTATTTGATACCAGTTTCCACCAGACGATGGCTCCGGAAGCTTATTTATACGGCCTGCCGTGGAAATATTATGAAGAGTTAGGTGTACGCCGTTA > 2:373268/1‑300 CATTGACAGATTGAATCTACAGTGGCCTTAATTGGCCACCGCATCGCTCACGGCGGCAGTATTTTTACCGAGTCCGCCATTATTACCGATGAAGTCATTGATAATATCCGTCGCGTTTCTCCACTGGCACCCCTGCATAATTACGCCAATTTAAGTGGTATTGAATCGGCGCAGCAATTATTTCCGGGCGNAACTCAGGTGGCGGTATTTGATACCAGTTTCCACCAGACGATGGCTCCGGAAGCTTATTTATACGGCCTGCCGTGGAAATATTATGAAGAGTTAGGTGTACGCCGTTAT > 1:679052/1‑300 TTGACANATTGAATCTACAGTGGCCTTAATTGGCCACCGCATCGCTCACGGCGGNAGTATTTTTACCGAGTCCGCCATTATTACCGATGAAGTCATTGATAATATCCGTCGCGTTTCTCCACTGGCACCCCTGCATAATTACGCCAATTTAAGTGGTATTGAATCGGCGCAGCAATTATTTCCGGGCGTAACTCAGGTGGCGGTATTTGATACCAGTTTCCACCAGACGATGGCTCCGGAAGCTTATTTATACGGCCTGCCGTGGAAATATTATGAAGAGTTAGGTGTACGCCGTTATGG < 2:764244/300‑1 TTGACAGATTGAATCTACAGTGGCCTTAATTGGCCACCGCATCGCTCACGGCGGCAGTATTTTTACCGAGTCCGCCATTATTACCGATGAAGTCATTGATAATATCCGTCGCGTTTCTCCACTGGCACCCCTGCATAATTACGCCAATTTAAGTGGTATTGAATCGGCGCAGCAATTATTTCCGGGCGTAACTCAGGTGGCGGTATTTGATACCAGTTTCCACCAGACGATGGCTCCGGAAGCTTATTTATACGGCCTGCCGTGGAAATATTATGAAGAGTTAGGTGTACGCCGTTATGG < 1:206783/300‑1 GAATCTACAGTGGCCTTAATTGGCCACCGCATCGCTCACGGCGGCAGTATTTTTACCGAGTCCGCCATTATTACCGATGAAGTCATTGATAATATCCGTCGCGTTTCTCCACTTGCACCCCTGCATAATTACGCCAATTTAAGTGGTATTGAATCGGCGCAGCAATTATTTCCGGGCGTAACTCAGGTGGCGGTATTTGATACCAGTTTCCACCAGACGATGGCTCCGGAAGCTTATTTATACGGCCTGCCGTGGAAATATTATGAAGAGTTAGGTGTctgtctcttatacacatctcgt < 1:334445/300‑23 ATCTACAGTGGCCTTAATTGGCCACCGCATCGCTCACGGCGGCAGTATTTTTACCGAGTCCGCCATTATTACCGATGAAGTCATTGATAATATCCGTCGCGTTTCTCCACTGGCACCCCTGCATAATTACGCCAATTTAAGTGGTATTGAATCGGCGCAGCAATTATTTCCGGGCGTAACTCAGGTGGCGGTATTTGATACCAGTTTCCACCAGACGATGGCTCCGGAAGCTTATTTATACGGCCTGCCGTGGAAATATTATGAAGAGTTAGGTGTACGCCGTTATGGTTTCCACGGCAC > 1:918012/1‑300 ATCACTGACATGGGACAGAGGAATGGAACTGGCCAGACATCTAGAATTTACTGTCAGCACCGGCGTTAAAGTTTACTTCTGCGATCCTCAGAGTCCTTGGCAGCGGGGAACAAATGAGAACACAAATGGGCTAATTCGGCAGTACTTTCCTAAAAAGACATGTCTTGCCCAATATACTCAACATGAACTAGATCTGGTTGCTGCTCAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1470221‑1470516‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGCCTTAATTGGCCACCGCATCGCTCACGGCGGCAGTATTTTTACCGAGTCCGCCATTATTACCGATGAAGTCATTGATAATATCCGTCGCGTTTCTCCACTGGCACCCCTGCATAATTACGCCAATTTAAGTGGTATTGAATCGGCGCAGCAATTATTTCCGGGCGTAACTCAGGTGGCGGTATTTGATACCAGTTTCCACCAGACGATGGCTCCGGAAGCTTATTTATACGGCCTGCCGTGGAAATATTATGAAGAGTTAGGTGTACGCCGTTATGGTTTCCACGGCACGT < NC_000913/3263423‑3263129 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |