Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 3,169,131 | IS30 (–) +2 bp | coding (100‑101/483 nt) | ygiV ← | DNA‑binding transcriptional repressor YgiV |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1470516 | NA (NA) | 107 (0.940) | 72/598 | 0.3 | 94.7% | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region |
? | NC_000913 | = 3169132 | 6 (0.050) | coding (100/483 nt) | ygiV | DNA‑binding transcriptional repressor YgiV | |||||
* | ? | NC_000913 | 3169131 = | 6 (0.050) | 138 (1.210) | 82/598 | 0.1 | 95.8% | coding (101/483 nt) | ygiV | DNA‑binding transcriptional repressor YgiV |
? | NC_000913 | = 4508679 | NA (NA) | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region |
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
TGCTTTACGCATTTTCTCGCCGCTTGCAGGCAGCCAGTGGCGAATGATGCCCCATACCGTGTGTGAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCCACAGGTATTGATGGGAAATCGATAATGTTTACATCCAGTGTCAGGTTTGTCATTTTGCCTCCCTGCGAAATTATTCCCGGGAACGCGTCCCGGGAGCGGTAACAATTACGGATTTACTTTGCGGATCTGTTTGACGTCAATTTCAACAGAATTCCAGTCTTTATCGACTTCACCCTGAATCTCAACCGTATCTTTCGGCGTCACCGTCACGCCGTTCCAGCGTTTGTGGTCGATATCAACATTGATAGTACCG > NC_000913/3168833‑3169431 | gcacgantgcgcattttggctgacaaaccagctcgtatctcctcgcgctcagacngtttcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaccatagttaagatcgttccgggttttgaacccacgatattcgctatttcacggaagcctgttctgctcttccatagttcaaaaacatagtcttgttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccgtgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaAc > 2:773568‑M1/299‑300 (MQ=255) gcacgaatgctcattttggctgacaaaccagctcgtatctcctcgcgctcagacagtttcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacatatgctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaAc > 2:50646‑M1/299‑300 (MQ=255) gcacgaatgctcattttggctgacaaaccagctcgtatctcctcgcgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaAc > 1:90354‑M1/299‑300 (MQ=255) gcacgaatgctcattttggctgacaaaccagctcgtatctcctcgcgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaAc > 2:397366‑M1/299‑300 (MQ=255) 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cattttggctgacaaaccagctcgtatctcctcgcgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctccttcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaACGCTGTAGTTGa < 2:909998‑M1/13‑1 (MQ=255) ttCTCGCCGCTTGCAGGCAGCCAGTGGCGAATGATGCCCCATACCGTGTGTGAAATATCGGCCAGTTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGGTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCATGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCTCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACtgtagattcaatc > 1:210535‑M2/1‑287 (MQ=255) ttGCAGGCAGCCAGTGGCGAATGATGCCCCATACCGTGTGTGAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATNGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACtgtagattcaatctgtcaatgca > 2:822178‑M2/1‑277 (MQ=255) 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agctcgtatctcctcgcgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatattgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGc > 1:93413‑M1/270‑300 (MQ=255) agctcggatctcctcgcgctcagacagtgtcagttgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatattgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagagnctttttcctctgctggaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcatataactgttgcgttgaccaattgaatctacnACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGc > 2:664529‑M1/270‑300 (MQ=255) ctcgtatctcctcgcgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctnatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgntgcgttgaccaattgaatctacaACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCgg > 2:864963‑M1/268‑300 (MQ=255) cgtatctcctcgcgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaACGATGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTAAAGCGGTg < 2:108184‑M1/35‑1 (MQ=255) ctcctcgcgcgcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCa > 1:898747‑M1/261‑300 (MQ=255) cgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccncttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgangcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacatacctgttgcgttgaccacttgaatctacaACGCTGTATTTGAGCACTTCCGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGc < 2:655288‑M1/47‑1 (MQ=255) gCCCCATACCGTGTGTGAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTCAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTACGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttccattatctctttcg < 1:107284‑M2/300‑49 (MQ=255) gCCCCATACCGTGTGTGAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAACTTTCGCCACtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttcaattatctctttcg < 2:499349‑M2/300‑49 (MQ=255) gCCCCATACCGTGTGTGAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttcaattatctctttcg < 1:375259‑M2/300‑49 (MQ=255) 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gtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggacattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccacttgaatctacaACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTAAAGCGGTGCGGCACCATCGCCACAGTTAtt < 1:722904‑M1/57‑1 (MQ=255) tgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccggtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagagnctttttcctctgctgtaaatgttcgtntcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCTACAGGTATTg > 2:619855‑M1/243‑300 (MQ=255) tgtgtgAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttcaattatctctttcggtgttttgaac < 1:527165‑M2/300‑60 (MQ=255) 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accaattgaatctacaACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCCACAGGTATTGATGGGAAATCGATAATGTTTACATCCAGTGTCAGGTTTGTCATTTTGCCTCCCTGCGAAATTATTCCCGGGAACGCGTCCCGGGAGCGGTAACAATTACGGATTTACTTTGCGGATCTGTTTGACGTCAATTTCAACAGAATTCCAGTCTTTATCGACTTCACCCTGAATCTCAACCGTATCTTTCGGCGTCACCGTCACGCCGTTCCAGCGTTTGTGGTCGatat > 1:798294‑M1/17‑300 (MQ=255) aTTTCGCCACtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttcaattatctctttcggtgttttgaacttcagtgtctttctcggtctgttgtttagctgagcagcaaccagatctagttcatgttgagtatattgggcaagacatgtctttttaggaaagtactgccgaattagcccatttgtgttctcatttgttccccgctgccaaggactctgaggatcgcagaagtaaactttaacgccggtgctgacagtaaattctagatgtctggccagttccattcctctgtcccatgtc > 1:264086‑M2/1‑10 (MQ=255) aCGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCCAAAGGTATTGATGGGAAATCGATAATGTTTACATCCAGTGTCAGGTTTGTCATTTTGCCTCCCTGCGAAATTATTCCCGGGAACTCGTCCCGGGAGCGGTAACAATTACGGATTTACTTTGCGGATCTGTTTGACGTCAATTTCAACAGAATTCCAGTCTTTATCGACTTCACCCTGAATCTCAACCTTATCTTTCGGCGTCACCGTCACGCCGTTCCAGCGTTTGTGGTCGATATCAACATTGATAGTAcc > 1:923985/1‑300 (MQ=255) | TGCTTTACGCATTTTCTCGCCGCTTGCAGGCAGCCAGTGGCGAATGATGCCCCATACCGTGTGTGAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCCACAGGTATTGATGGGAAATCGATAATGTTTACATCCAGTGTCAGGTTTGTCATTTTGCCTCCCTGCGAAATTATTCCCGGGAACGCGTCCCGGGAGCGGTAACAATTACGGATTTACTTTGCGGATCTGTTTGACGTCAATTTCAACAGAATTCCAGTCTTTATCGACTTCACCCTGAATCTCAACCGTATCTTTCGGCGTCACCGTCACGCCGTTCCAGCGTTTGTGGTCGATATCAACATTGATAGTACCG > NC_000913/3168833‑3169431 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |