| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,169,131 | IS30 (–) +2 bp | coding (100‑101/483 nt) | ygiV ← | DNA‑binding transcriptional repressor YgiV |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1470516 | NA (NA) | 107 (0.940) | 72/598 | 0.3 | 94.7% | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3169132 | 6 (0.050) | coding (100/483 nt) | ygiV | DNA‑binding transcriptional repressor YgiV | |||||
| * | ? | NC_000913 | 3169131 = | 6 (0.050) | 138 (1.210) | 82/598 | 0.1 | 95.8% | coding (101/483 nt) | ygiV | DNA‑binding transcriptional repressor YgiV |
| ? | NC_000913 | = 4508679 | NA (NA) | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
TGCTTTACGCATTTTCTCGCCGCTTGCAGGCAGCCAGTGGCGAATGATGCCCCATACCGTGTGTGAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCCACAGGTATTGATGGGAAATCGATAATGTTTACATCCAGTGTCAGGTTTGTCATTTTGCCTCCCTGCGAAATTATTCCCGGGAACGCGTCCCGGGAGCGGTAACAATTACGGATTTACTTTGCGGATCTGTTTGACGTCAATTTCAACAGAATTCCAGTCTTTATCGACTTCACCCTGAATCTCAACCGTATCTTTCGGCGTCACCGTCACGCCGTTCCAGCGTTTGTGGTCGATATCAACATTGATAGTACC > NC_000913/3168833‑3169430 | gcacgantgcgcattttggctgacaaaccagctcgtatctcctcgcgctcagacngtttcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaccatagttaagatcgttccgggttttgaacccacgatattcgctatttcacggaagcctgttctgctcttccatagttcaaaaacatagtcttgttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccgtgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaAc > 2:773568‑M1/299‑300 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gcctcgcgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggagattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCaa > 1:822886‑M1/260‑300 (MQ=255) atgatgCCCCATACCGTGTGTGAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttcaattatctc < 1:38694‑M2/300‑44 (MQ=255) cgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGc < 1:9096‑M1/47‑1 (MQ=255) cgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaACGATGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGc < 1:227250‑M1/47‑1 (MQ=255) gCCCCATACCGTGTGTGAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTCAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTACGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttccattatctctttcg < 1:107284‑M2/300‑49 (MQ=255) gCCCCATACCGTGTGTGAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGTTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttcaactatctctttcg < 1:210197‑M2/300‑49 (MQ=255) 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TGCTTTACGCATTTTCTCGCCGCTTGCAGGCAGCCAGTGGCGAATGATGCCCCATACCGTGTGTGAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCCACAGGTATTGATGGGAAATCGATAATGTTTACATCCAGTGTCAGGTTTGTCATTTTGCCTCCCTGCGAAATTATTCCCGGGAACGCGTCCCGGGAGCGGTAACAATTACGGATTTACTTTGCGGATCTGTTTGACGTCAATTTCAACAGAATTCCAGTCTTTATCGACTTCACCCTGAATCTCAACCGTATCTTTCGGCGTCACCGTCACGCCGTTCCAGCGTTTGTGGTCGATATCAACATTGATAGTACC > NC_000913/3168833‑3169430 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |