Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 2,174,851 | IS1 (+) +8 bp | coding (192‑199/453 nt) | gatA ← | galactitol‑specific PTS enzyme IIA component |
New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 2174851 = | 0 (0.000) | coding (199/453 nt) | gatA | galactitol‑specific PTS enzyme IIA component | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 132 (1.200) | 83/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 2174858 | 0 (0.000) | coding (192/453 nt) | gatA | galactitol‑specific PTS enzyme IIA component |
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
TTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATCCCGGTAGGGAATTCTGCTTCTCTGGCAATTAATGCCTGTGGCCAGGTATCATGAACCACACCTTTGGCGAGCATCTCATTACCGATATGGGTTAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCATAATCAGCTGATGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTG > NC_000913/2174562‑2175151 | aGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCCgttgatgctgcc > 1:233868‑M2/1‑288 (MQ=255) acgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGAATCGCCTCACAATGCGGTATTg > 1:845945‑M2/277‑300 (MQ=255) tttttATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCCggtgatgctgccaactt < 1:469937‑M2/300‑18 (MQ=255) tttttATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCATTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTAGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACATCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAAACAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGAATTAGCATGAATCGAAggtgatactgcaaactt < 2:348335‑M2/300‑18 (MQ=255) 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ttGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCAggtgatgctgccaacttactgat < 1:405945‑M2/300‑24 (MQ=255) ttGTTAAAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTAGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACCGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGACggtgatgctgccaacttactgat < 2:75342‑M2/300‑24 (MQ=255) ataagagacagggatttattCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCCggtgatgctgccaacttactgat > 2:84071‑M2/10‑277 (MQ=255) cttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGtgct > 1:883099‑M2/265‑300 (MQ=255) ttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaaaataaaacactatcaataagttggagtcattaccGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCCATAGCGtgctg > 2:25724‑M2/264‑300 (MQ=255) cAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTTTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGTAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCCggtgatgctgccaacttactgatttagtg > 1:321363‑M2/1‑271 (MQ=255) cAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCCggtgatgctgccaacttactgatttagtg < 1:256209‑M2/300‑30 (MQ=255) gATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTGTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTGATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgat > 2:233133‑M2/1‑265 (MQ=255) ctgctttcaccctttgacgtgttgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCa < 1:795885‑M2/45‑1 (MQ=255) gtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATc > 1:30462‑M2/251‑300 (MQ=255) tcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATcc < 1:870278‑M2/51‑1 (MQ=255) ccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataagacactatcaataagttggagtcattaccGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATCCCgg > 2:744586‑M2/247‑300 (MQ=255) 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tcattaccGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCATGCTGCTCAAGCATTATCCCGGTAGGGAATTCTGCTTCTCTGGCAATTAATGCCTGTGGCCAGGTATCATGAACCACACCTTTGGCGAGCATCTCATTACCGATATGGGTTAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGGTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCATAATCAGCTGATGCGGTATTGCTGATAATTc < 1:180189‑M2/292‑1 (MQ=255) cTTAGCATGAATCGCCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtntttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgntatggccatgaatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcc > 2:799389‑M2/1‑16 (MQ=255) aGCATGAATCGCCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcctca < 1:546217‑M2/300‑288 (MQ=255) aGCATGAATCGCCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttngaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatgnccatgaatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcctcc < 2:817340‑M2/300‑288 (MQ=255) cATGAATCGCCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcctcaac > 1:482626‑M2/1‑11 (MQ=255) aaTCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATCCCGGTAGGGAATTCTGCTTCTCTGGCAATTAATGCCTGTGGCCAGGTATCATGAACCACACCTTTGGCGAGCATCTCATTACCGATATGGGTTAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCCTAAATTTTATCCATAATCAGCTGATGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTg > 1:539164/1‑300 (MQ=255) | TTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATCCCGGTAGGGAATTCTGCTTCTCTGGCAATTAATGCCTGTGGCCAGGTATCATGAACCACACCTTTGGCGAGCATCTCATTACCGATATGGGTTAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCATAATCAGCTGATGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTG > NC_000913/2174562‑2175151 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |