| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 2,174,851 | IS1 (+) +8 bp | coding (192‑199/453 nt) | gatA ← | galactitol‑specific PTS enzyme IIA component |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 2174851 = | 0 (0.000) | coding (199/453 nt) | gatA | galactitol‑specific PTS enzyme IIA component | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 132 (1.200) | 83/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2174858 | 0 (0.000) | coding (192/453 nt) | gatA | galactitol‑specific PTS enzyme IIA component | |||||
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
CTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATCCCGGTAGGGAATTCTGCTTCTCTGGCAATTAATGCCTGTGGCCAGGTATCATGAACCACACCTTTGGCGAGCATCTCATTACCGATATGGGTTAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCATAATCAGCTGATGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGAC > NC_000913/2174555‑2175149 | ttCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCCggt > 1:849634‑M2/1‑297 (MQ=255) 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atcaataagttggagtcattaccGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATCCCGGTAGGGAATTCTGCTTCTCTGGCAATTAATGCCTGTGGCCAGGTATCATGAACCACACCTTTGGCGAGCATCTCATTACCGATATGGGTTAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCATAATCAGCTGATGCgg > 1:877817‑M2/24‑300 (MQ=255) aagttggagtcattaccGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATCCCGGTAGGGAATTCTGCTTCTCTGGCAATTAATGCCTGTGGCCAGGTATCATGAACCACACCTTTGGCGAGCATCTCATTACCGATATGGGTTAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTGAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCATAATCAGCTGATGCGGTATTGc < 1:227184‑M2/283‑1 (MQ=255) gCTGACGACTTAGCATGAATCGCCgttgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccagacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatggg > 2:550299‑M2/1‑24 (MQ=255) gCTGACGACTTAGCATGAATCGCCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatggg < 1:764527‑M2/300‑277 (MQ=255) agtccttaccGACCCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATCCCGGTAGGGAATGCTGCGTCTCTGGCAATTAATGCCTGTGGCCAGGTATCATGAACCACACCTTTGGCGAGCNTCTCATTACCGATATGGGTGAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAGCAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACATCCTTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCGTAATCAGCTGATGCGGTATTGCTGATAAt < 2:212027‑M2/290‑1 (MQ=255) tcattaccGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCATGCTGCTCAAGCATTATCCCGGTAGGGAATTCTGCTTCTCTGGCAATTAATGCCTGTGGCCAGGTATCATGAACCACACCTTTGGCGAGCATCTCATTACCGATATGGGTTAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGGTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCATAATCAGCTGATGCGGTATTGCTGATAATTc < 1:180189‑M2/292‑1 (MQ=255) 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CTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCCTCACAATGCGGTATTGCAATAGCGTGCTGCTCAAGCATTATCCCGGTAGGGAATTCTGCTTCTCTGGCAATTAATGCCTGTGGCCAGGTATCATGAACCACACCTTTGGCGAGCATCTCATTACCGATATGGGTTAAAACTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCATAATCAGCTGATGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGAC > NC_000913/2174555‑2175149 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |