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| * | ? | NC_000913 | = 3653230 | NA (NA) | 137 (1.180) | 88/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4539115 = | 0 (0.000) | coding (387/717 nt) | nanC | N‑acetylneuraminate outer membrane channel | |||||
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TGTTTTCCGATAAATTATCTCTGCCGTTGTAAACACCCTGACGGTCAAGGTAGTCATATTCTATGTATGGCGTAATATCGGGCGTCATATGGTATTGTAGAACAAATGCATTTTCCGTCGCCCATTTCTTATGGTTTGCATAGCGATAATCGTTCTGTTTGCTGTATAGCGTCGTTTGCCATGCGAAGGTGAAATCACTATTAATATGGTAAGTGACATATCCATCCCAACGATGAACGTTATCACGAGACATATCACCGGATAAGTCTTGTTGTCGGTAAGCTTTCCAGTCGTAACGATAGCGAATGCCAAAATTAAGATCTTTTGTCGCGTCCCAGGACAGTTTTACGTAGGGTCCGTAGCGTGTGCCGTTGCTGCTAAAATGCGTTAACATTCCCGGGCGCACCGTCCATTGATCATCAAGTTTAATCGCGTAATTAACTTCAACCTGAACATCATTGAGTGCGGCATTTTCCTTTTTATTATCATGAATGGTATTCCAGGTATTACTTTCCATGCTTGCCCACCATCCATTTTGCCATCCCTCACTGACTTTGAGTCGAGTCTCATAGGCGTGGCTTCCACTACGATATCCACC > NC_000913/4538817‑4539414 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |