Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 4,539,115 | IS5 (–) +4 bp | coding (384‑387/717 nt) | nanC ← | N‑acetylneuraminate outer membrane channel |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 3653230 | NA (NA) | 137 (1.180) | 88/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | 4539115 = | 0 (0.000) | coding (387/717 nt) | nanC | N‑acetylneuraminate outer membrane channel |
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TTTTCCGATAAATTATCTCTGCCGTTGTAAACACCCTGACGGTCAAGGTAGTCATATTCTATGTATGGCGTAATATCGGGCGTCATATGGTATTGTAGAACAAATGCATTTTCCGTCGCCCATTTCTTATGGTTTGCATAGCGATAATCGTTCTGTTTGCTGTATAGCGTCGTTTGCCATGCGAAGGTGAAATCACTATTAATATGGTAAGTGACATATCCATCCCAACGATGAACGTTATCACGAGACATATCACCGGATAAGTCTTGTTGTCGGTAAGCTTTCCAGTCGTAACGATAGCGAATGCCAAAATTAAGATCTTTTGTCGCGTCCCAGGACAGTTTTACGTAGGGTCCGTAGCGTGTGCCGTTGCTGCTAAAATGCGTTAACATTCCCGGGCGCACCGTCCATTGATCATCAAGTTTAATCGCGTAATTAACTTCAACCTGAACATCATTGAGTGCGGCATTTTCCTTTTTATTATCATGAATGGTATTCCAGGTATTACTTTCCATGCTTGCCCACCATCCATTTTGCCATCCCTCACTGACTTTGAGTCGAGTCTCATAGGCGTGGCTTCCACTACGATATCCACCAC > NC_000913/4538819‑4539416 | cgcgccatcgctcaggttgtaccaatgctgcatgcagtgaatgcgtagcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccATAg < 1:211492‑M2/4‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |