| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 737973 = | 151 (1.300) | 88 (0.830) +AGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTG |
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| ? | NC_000913 | = 3624614 | 138 (1.190) | coding (237/1137 nt) | yhhI | putative transposase | |||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
TATCAGTTCTGCTGATTTAACCGCAGAAAAGTTCGCCACAGCAATCCGAAACCACTGGCACGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAAT > NC_000913/737676‑738272 | tatCAGTTCTGCTGATTTAACCGCAGAAAAGTTCGCCACAGCAATCCGAAACCACTGGCACGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCttt > 2:28398/1‑300 (MQ=255) ttAACCGCAGAAAAGTTCGCCACAGCAATCCGAAACCACTGGCACGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTc < 2:554903/300‑1 (MQ=255) gTTCGCCACAGCAATCCGAAACCACTGGCACGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTa > 2:156536/1‑300 (MQ=255) caGCAATCCGAAACCACTGGCACGTGGAGAANAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATAAGGCANATCGCTATTAATATTTTAACGAATGAGAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAGAATTga > 2:663550/1‑300 (MQ=255) cAATCCGAAACCACTGGCGCGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGTAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGat < 2:195971/300‑1 (MQ=255) ccGAAACCACTGGCACGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAATACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTc > 1:522093/1‑300 (MQ=255) aCTGGCACGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTAc < 1:380362/300‑1 (MQ=255) 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gggaaagatcacgtaacgctactTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAac < 2:731232‑M1/277‑1 (MQ=255) ttCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATc > 1:429037/1‑300 (MQ=255) gCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTNCCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGNAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCa > 2:890301/1‑300 (MQ=39) | TATCAGTTCTGCTGATTTAACCGCAGAAAAGTTCGCCACAGCAATCCGAAACCACTGGCACGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAAT > NC_000913/737676‑738272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |