New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 737973 = | 151 (1.300) | 88 (0.830) +AGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTG |
56/548 | 0.6 | 39.9% | intergenic (+1274/‑119) | ybfQ/ybfD | inactive transposase YbfQ/H repeat‑associated putative transposase YbfD |
? | NC_000913 | = 3624614 | 138 (1.190) | coding (237/1137 nt) | yhhI | putative transposase |
ATCGGGATGTGTTTCCCCAAAATCCTCTATATCTTCCCAGCCTTCTGCACCAGAAATAACGGCACAAATAGTCAACAGTAGAATATCCGATAATTTATGTTCCACTTTCCAGGCTTGTCTGTAATCGGGGATAATAGAAATATGTTCCATCAATTTTTTAAGTTCCATTTTGTTCTCCTTAATTATGTAAGAAGTATTTGATCATGTATAAGCAATAAAAAACAGCTTCAGGTAATAAGGAATATCTCAATTTTTAAACATAAAATGCGAATTATTTAGTACAAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/738259‑737973 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGATACAACTCTGGCAATGGTATCGTGAACAGGAATACCATTTTCAAAATC‑ACCATATTGCTTCAAAAAATCGAGATGTGTTTCCCCAAAATCCTCTATATCTTCCCAACCTTCTGCACCAGAAATAACGGCACAAATAGTCAACAGTAGAATATCCGATAATT < NC_000913/3624614‑3624451 ||||||||||||||||||||||||| ATCGGGATGTGTTTCCCCAAAATCCTCTATATCTTCCCAGCCTTCTGCACCAGAAATAACGGCACAAATAGTCAACAGTAGAATATCCGATAATTTATGTTCCACTTTCCAGGCTTGTCTGTAATCGGGGATAATAGAAATATGTTCCATCAATTTTTTAAGTTCCATTTTGTTCTCCTTAATTATGTAAGAAGTATTTGATCATGTATAAGCAATAAAAAACAGCTTCAGGTAATAAGGAATATCTCAATTTTTAAACATAAAATGCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGT < 1:441349/300‑1 GGATGTGTTTCCCCAAAATCCTCTATATCTTCCCAGCCTTCTGCACCAGAAATAACGGCACAAATAGTCAACAGTAGAATATCCGATAATTTATGTTCCACTTTCCAGGCTTGTCTGTAATCGGGGATAATAGAAATATGTTCCATCAATTTTTTAAGTTCCATTTTGTTCTCCTTAATTATGTAGGAAGTATTTGATCATGTATAAACAATAAACAACAGCTTCCGGTAATACGGAATATCTCAATTTTTAAACATAAAATGCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATC > 1:432321/1‑300 GGATGTGTTTCCCCAAAATCCTCTATATCTTCCCAGCCTTCTGCACCAGAAATAACGGCACAAATAATCAACAGTAGAATATCCGATAATTTATGTTCCACTTTCNAGGCTTGTCTGTAATCGGGGATAATAGAAATATGTTCCATCAATTTTTTAAGTTCCATTTTGTTCTCCTTAATTATGTAAGAAGTATTTGATCATGTATAAGCAATAAAAAACAGCTTCAGGTAATAAGGAATATCTCAATTTTTAAACATAAAATGCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATC < 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CATTTTGTTCTCCTTAATTATGTAAGAAGTATTTGATCATGTATAAGCAATAAAAAACAGTTTCAGGTAATAGGGAATGTCTCGATTTTTAAACATAAAATGCGAATTATTTAGGACAAAAAAGTGGCGTTACGTGATCTTTCTCTGGGATACAACTCTGGCAATGGTATCGTGAACAGGAATACCATTTTCAAAATC‑ACCATATTGCTTCAAAAAATCGAGATGTGTTTCCCCGAAATCCTCTATATCTTCCCAACCTTCTGCACCAGAAATAACGGCACAAATAGTCAACAGTAGAAT < 1:728430/300‑1 CCTTAATTATGTAAGAAGTATTTGATCATGTATAAGCAATAAAAAACAGCTTCAGGTAATAAGGAATATCTCAATTTTTAAACATAAAATGCGAATTATTTAGTACAAAAAAGTAGCGTTACGTGATCTTTCCCTGGGATACAACTCTGGCAATGGTATCGTGAACAGGAATACCATTTTCAAAATC‑ACCATATTGCTTCAAAAAATCGAGATGTGTTTCCCCGAAATCCTCTATATCTTCCCAACCTTCTGCACCAGAAATAACGGCACAAATAGTCAACAGTAGAATATCTGACAATT > 1:417094/1‑300 ||||||||||||||||||||||||| ATCGGGATGTGTTTCCCCAAAATCCTCTATATCTTCCCAGCCTTCTGCACCAGAAATAACGGCACAAATAGTCAACAGTAGAATATCCGATAATTTATGTTCCACTTTCCAGGCTTGTCTGTAATCGGGGATAATAGAAATATGTTCCATCAATTTTTTAAGTTCCATTTTGTTCTCCTTAATTATGTAAGAAGTATTTGATCATGTATAAGCAATAAAAAACAGCTTCAGGTAATAAGGAATATCTCAATTTTTAAACATAAAATGCGAATTATTTAGTACAAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/738259‑737973 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGATACAACTCTGGCAATGGTATCGTGAACAGGAATACCATTTTCAAAATC‑ACCATATTGCTTCAAAAAATCGAGATGTGTTTCCCCAAAATCCTCTATATCTTCCCAACCTTCTGCACCAGAAATAACGGCACAAATAGTCAACAGTAGAATATCCGATAATT < NC_000913/3624614‑3624451 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |