Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 3,546,574 | IS2 (+) +5 bp | coding (16‑20/1317 nt) | gntT → | high‑affinity gluconate transporter |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 3186096 = | NA (NA) | 152 (1.360) | 84/594 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
? | NC_000913 | = 3546578 | 0 (0.000) | coding (20/1317 nt) | gntT | high‑affinity gluconate transporter |
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
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tgCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggagaacaggttgttcc > 1:7906‑M2/1‑3 (MQ=255) tgCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtcnccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggagaacaggttgttcc < 1:589150‑M2/300‑298 (MQ=255) cTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTCCTGATGATCCGCTTCAAAATGAACGGCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTa > 1:710059/1‑300 (MQ=255) | GCGCAGCATTGCTTTGTCAAATCCTCGGTTCGTTTCCCCGCGATAATATGACCAACCTCTCATAATTTAAATTTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTCCTGATGATCCGCTTCAAAATGAACGGCTTCATCGCTCTCGTCCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTA > NC_000913/3546280‑3546877 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |