| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,546,574 | IS2 (+) +5 bp | coding (16‑20/1317 nt) | gntT → | high‑affinity gluconate transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2996361 = | NA (NA) | 116 (1.030) | 76/598 | 0.2 | 98.3% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3546574 = | 2 (0.020) | coding (16/1317 nt) | gntT | high‑affinity gluconate transporter | |||||
| * | ? | NC_000913 | 3186096 = | NA (NA) | 152 (1.360) | 84/594 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3546578 | 0 (0.000) | coding (20/1317 nt) | gntT | high‑affinity gluconate transporter | |||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3186392‑3186096‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAACCGAGGATTTGACAAAGCAATGCT < NC_000913/3546578‑3546284 GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCATAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGCA < 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AGTCTAGCAACAATGACTAATTGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAACCGAGGATTTGACAAAGCAATGC < 1:651167/300‑1 AGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGTTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAACCGAGGATTTGACAAAGCAATGC < 1:676054/300‑1 AGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAACCGAGGATTTGACAAAGCAATGC < 1:567522/300‑1 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GTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAACCGAGGATTTGACAAAGCAATGCT > 2:33929/1‑300 GTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCAAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCGGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAACCGAGGATTTGACAAAGCAATGCT > 2:457325/1‑300 GTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATAGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATGCGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGTGGGGTAAATTTACATTATGAGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAACCGAGGATTTGACAAAGCAATGCT > 1:145994/1‑300 GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3186392‑3186096‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGGTCATATTATCGCGGGGAAACGAACCGAGGATTTGACAAAGCAATGCT < NC_000913/3546578‑3546284 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |